為確保地震災區的水質安全，水利部于5月17日和24日先後從長委、黃委、淮委、海委抽調兩批次、四支應急水質監測小組共39人，攜帶移動水質監測車和快速檢測設備，馳援災區，配合當地對災區飲用水源地進行監測。

    5月18-24日，首批由長委、黃委水資源保護局水環境監測中心16名技術人員組成的應急水質監測小組，深入都江堰、彭州、江油、安縣、綿竹、什邡、溫江、漢源、寶興、大邑、郫縣等地震重災區，冒著危險，採集城市集中飲用水源地和農村飲用水源地水樣208個，對pH、電導率、濁度、氨氮等指標進行檢測分析，抽樣檢測結果未見異常。兩支監測隊伍還對沿途的農村分散水源進行檢測，並及時向群眾公告檢測結果，受到災區群眾歡迎。

    為擴大供水水源巡迴監測範圍，5月24日，水利部從淮委、海委水資源保護局再次抽調13名技術人員支援重點災區開展水質巡測。4支監測隊伍通過協商，將影響災區592萬人口的112處集中式供水水源地劃分為4個片區，自25日起每3天對所有集中式飲用水源地普遍監測一次，數據由長江委監測小組統一匯總上報。