4月24日，衛生部召開電視電話會議，傳達落實2009年全國愛國衛生運動委員會全體會議精神，進一步部署當前愛國衛生重點工作。衛生部部長陳竺在會上強調，在當前手足口病防控任務艱巨的情況下，大力開展環境綜合治理，從源頭控制和減少季節性傳染病的發生，是當前愛國衛生工作的重中之重。

    陳竺介紹，2009年1月1日至4月23日24時，全國（不含港澳臺地區）累計報告手足口病病例230362例，重症2074例，死亡79例。報告病例數居前10位的省區依次是河南、山東、江蘇、河北、廣西、廣東、安徽、湖北、湖南和浙江。他説，手足口病、艾滋病、結核病、肝炎等傳染病還未得到有效遏制，嚴重威脅人民群眾的健康。在農村，要將愛國衛生運動與環境保護專項整治等工作結合起來，共同推進；在城市，要進一步完善衛生城鎮標準體系。同時，要大力開展健康教育，加強健康教育機構和網絡建設，廣泛宣傳普及衛生知識，增強群眾自我保健能力。

    陳竺説，2008年，全國農村的改水改廁工作取得了長足進步，農村衛生廁所和自來水普及率分別達到59.7%和65.5%，愛國衛生運動在衛生城鎮建設和重大事件的衛生保障中都發揮了不可替代的作用。他要求，全體愛衛工作者把愛衛工作作為公共衛生服務體系的重要內容和實現基本公共衛生服務均等化目標的有效途徑，紮實推進。