2009年11月2日，內地與澳門科技合作委員會第三次會議在北京召開。科學技術部副部長曹健林、澳門特別行政區運輸工務司司長劉仕堯出席會議並致辭。兩地科技合作委員會委員以及相關機構的代表近60人參加會議。

    會議回顧和總結了內地與澳門科技合作委員會第二次會議以來兩地科技合作與交流發展狀況，聽取了各個工作組的進展彙報，對今後兩地科技合作的工作重點和方向進行了討論並達成了共識。委員們認為：一年多以來，兩地科技合作與交流取得了較大發展。具體體現在以下幾個方面：在節能環保等科技領域的合作不斷深入；在推動澳門科普教育和展覽等工作中效果顯著；完成首批澳門專家入選國家科技計劃專家庫工作；逐步推進在澳門建設國家重點實驗室夥伴實驗室的工作等。此外，在兩地科技合作委員會的框架下，粵澳等區域創新合作也取得積極進展。

    委員們經過討論後一致認為，新形勢下有必要進一步發展和擴大內地與澳門的科技交流與合作。未來一年將推動澳門科研機構及人員參與國家重大科技計劃；繼續推動在澳門建立國家重點實驗室夥伴實驗室工作；兩地合作培養葡語科技管理人員；加強粵澳的區域創新體系建設以及在中醫藥、節能環保、電子信息等雙方共同感興趣領域的合作。同時，兩地政府將繼續支持內地與澳門開展各種形式的科技交流與合作。

    科學技術部曹健林副部長在會議中指出，澳門的科技發展是國家科技總體發展的有機組成部分，兩地的科技合作對於繁榮兩地經濟、建設創新型國傢具有非常重要的意義；兩地科技界只有通過加強科技合作，共同提高科技創新能力，才能在促進産業升級，抵禦國際經濟風險方面有所作為。希望在本次會議後，進一步加強兩地科技合作委員會工作層面的協商與溝通，並不斷探索新的合作方式和領域，推動內地與澳門的科技合作邁上新的臺階，為繁榮兩地經濟和加速建設創新型國家做出新的更大貢獻。

    澳門特別行政區運輸工務司司長劉仕堯在會議中指出，內地與澳門科技合作委員會的設立對促進澳門科技發展發揮了重要作用。自簽署協議以來，委員會已經召開了兩次會議，聯絡辦公室及四個工作組開展了一系列卓有成效的工作，雙方已經建立了堅實的合作基礎。希望內地與澳門在現有的良好基礎上，進一步加強合作和交流，切實促進兩地科技及産業的發展。

    2005年10月6日，科技部與澳門特別行政區科技委員會簽署了《內地與澳門成立科技合作委員會協議》，共同成立“內地與澳門科技合作委員會”。該委員會成立後，負責統籌和協調內地與澳門的科技交流與合作。委員會成員由科學技術部、工業信息化部、環境保護部、衛生部、國務院港澳事務辦公室、中央駐澳聯絡辦、中科院、國家自然基金委、中國科學技術協會、廣東省、珠海市等內地單位，以及澳門特別行政區政府運輸工務司、澳門科技發展基金等相關澳門科技部門和機構組成。委員會主席分別由科學技術部分管副部長和澳門特別行政區運輸工務司司長擔任。

    “內地與澳門科技合作委員會”內地成員單位科技部港澳臺辦公室副主任葉冬柏、政策法規司副司長李普、基礎司副司長廖小罕、高新司副巡視員楊鹹武、社發司副司長楊哲、交流中心主任孫洪、交流中心副主任赫文平、中央人民政府駐澳門聯絡辦公室經濟部副部長高尚德、工業和信息化部科技司副司長韓俊、中科院港澳臺辦主任張興根、國家自然基金委國際合作局副局長王逸、中國科協國際聯絡部副部長李秀亭，以及衛生部、上海市科委、廣東省科技廳、珠海市政府等部門的代表參加了本次會議。