8月7日23時許，汶川地震重災區甘肅省甘南藏族自治州舟曲縣城東北部山區突降特大暴雨，引發兩條溝係爆發特大山洪泥石流。8月9日，甘肅檢驗檢疫局黨組迅即召開黨組擴大會議，提出三條措施，決定舉全局之力全力援助舟曲災區。一是立即成立由分管局長負責的防疫小分隊，抽調專業技術人員，隨時準備趕赴災區做好災後防疫工作。二是詳細了解舟曲籍職工家鄉的受災情況，根據受災程度給予相應的幫扶。三是在全局發起向舟曲泥石流災區捐款捐物的號召，為災區的重建工作盡責盡力。

    同時，甘肅檢驗檢疫局將嚴格按照國家法律法規和總局的各項規定要求，依法做好進境貨物、人員和交通運輸工具的檢驗檢疫工作，保障檢驗檢疫工作秩序和工作質量，全面確保境外救援物資安全便利通關。全局職工積極響應黨組號召，紛紛捐款獻愛心，向震區人民伸出援助之手，為震區人民奉獻一片愛心，為儘快儘早地營救被困群眾和恢復災區人民的生産生活秩序貢獻我們的力量，幫助災區人民重建家園。