7月3日，衛生部與上海市人民政府正式簽定《衛生部 上海市人民政府進一步深化部市合作協議書》和《衛生部 上海市人民政府共建共管在滬衛生部管理單位補充協議》。衛生部部長陳竺，上海市委副書記、市長韓正出席會議並講話，共同簽署相關協議。

    陳竺在講話中指出，醫改實施兩年多來，國務院有關部門和各地黨委、政府一起，積極行動，有序推進五項重點改革，取得了明顯進展和初步成效，人民群眾已從中得到實惠。但我們也清醒地認識到，隨著醫改的深入，醫改面臨的形勢依然緊迫。要實現醫改的各項目標，必須堅持保基本、強基層、建機制，必須統籌安排、突出重點、循序推進，必須充分發揮各地的積極性和創造性，鼓勵和支持各地從實際出發，積極探索，大膽改革，率先在一些關鍵領域取得突破，積累經驗。

    據悉，上海的醫療衛生改革一直走在全國前列，上海在公立醫院改革、信息化建設等方面都是全國的試點城市，衛生部的很多改革舉措均總結借鑒了上海的經驗。多年來，衛生部與上海市政府一直保持著良好的部市合作關係：2009年，衛生部和上海市政府簽署了《共建共管在滬衛生部管理醫院協議》，對6所部管醫院進行共建共管。

    有關人士稱，此次衛生部和上海市政府簽署的《進一步深化部市合作協議書》，是在原有共建共管在滬醫院合作協議的進一步擴展和提升，合作共建走向深度，內容更加豐富，不僅是在部管醫院方面，而且在醫療服務、公共衛生、中醫藥、食品藥品監管、醫學科研人才、衛生信息化等各方面。此次衛生部與上海市政府還簽署了《共建共管在滬衛生部管理單位補充協議》，進一步共建寄生蟲病預防控制所，共同應對新的形勢和挑戰，提高中國疾病預防控制及科學研究的綜合實力，提升上海市疾控工作的整體水平，為中國熱帶病防治事業作出貢獻。