國家衛生和計劃生育委員會通報上海、安徽先後出現多例人感染H7N9禽流感病毒病例後，國家林業局迅速研究部署有關應對工作，下發通知強化野生動物疫源疫病監測防控工作，緊急派出督導組赴有關省份開展督查和H7N9禽流感疫情隱患排查工作。
上海地處東亞-澳大利亞候鳥遷徙通道的停歇地和取食地的關鍵節點，近年來國家林業局高度重視東部候鳥遷徙通道禽流感疫情防控工作，組織開展了上海等東部區域候鳥遷徙通道的主動預警工作，每年在上海安排樣品採集與檢測工作，每年取樣300多份，從近年來檢測的結果看，野生候鳥未檢測出甲型H7N9禽流感病毒。
自3月29日接到衛生部通報上海、安徽等地發生的人感染H7N9亞型禽流感事件以來，國家林業局快速反應，第一時間安排部署，積極應對，切實做好陸生野生動物疫源疫病監測防控。3月29日當晚即第一時間通知上海林業主管部門，切實做好陸生野生動物疫源疫病監測防控工作，加強對遷徙候鳥停歇地、野生鳥類馴養繁殖場所和動物園、濕地公園等人與野生鳥類近距離接觸區域的觀測和巡護工作，有條件的地區儘快組織開展採樣送檢工作，以便配合做好疫情溯源工作。第二天立即下發了緊急通知，要求各地林業部門加強野生動物疫源疫病監測防控工作，嚴格執行監測防控信息日報告制度，擴大巡護監測的覆蓋範圍和巡查力度，確保野生動物病死等異常情況第一時間發現、第一現場處置。
4月2日林業局派出督導組赴上海市開展陸生野生動物疫源疫病監測防控督導檢查工作，實地查看了上海崇明東灘鳥類國家級自然保護區、上海動物園和上海野生動物園等地的監測防控工作開展情況，督促做好城市中心疫源野生動物聚居區野生動物疫源疫病監測防控工作。同時，組織有關專家開展了遷徙候鳥和人工馴養繁殖鳥類樣品採集工作，目前正在對有關樣品進行檢測分析。
