為進一步提高會計師事務所科技經費審計質量，強化對會計師事務所相關業務的指導、監督、評價，2013年6月起科技部將對具有國家科技經費審計資格的208家會計師事務所開展專項監督檢查，檢查工作計劃在3年內分階段完成。今年，科技部組織安排5個檢查小組，將分赴北京、上海、江蘇等11個省市對抽取的71家會計師事務所開展專項監督檢查。檢查小組將通過與會計師事務所座談、現場檢查、核實審計工作底稿和發放調查表等手段，了解和掌握會計師事務所開展科技經費審計的實際情況，檢查會計師事務所有無違反職業規範和雙方審計約定的問題。同時，檢查小組還要了解會計師事務所在開展科技經費審計工作中遇到的困難和問題，聽取有關意見和建議，以便進一步改進和提高科技經費審計監督水平。