為鼓勵科技型中小企業技術創新，促進科技成果轉化，1999年，經國務院批准，中央財政設立首只專門支持中小企業的專項資金——科技型中小企業技術創新基金（以下簡稱創新基金）。近年來，中央財政不斷加大對創新基金的投入力度，完善政策內容，對於提升科技型中小企業的技術創新能力，促進科技成果轉化，推動産業升級和結構調整等發揮了十分重要的作用。

    1999-2013年，中央財政累計安排創新基金268.26億元，主要用於以下幾個方面：一是支持中小企業開展技術創新活動。根據黨中央、國務院增強企業自主創新能力、加快培育和發展戰略性新興産業等戰略部署，重點支持科技型中小企業圍繞電子信息、生物醫藥、新材料、光機電一體化、資源與環境、新能源與高效節能、高技術服務業等領域開展技術創新活動。二是支持改善技術創新創業環境。2006年起，中央財政在創新基金中安排專門資金，實施中小企業公共技術服務補助資金項目，支持中小企業公共服務機構為科技型中小企業提供創新資源共享服務、專業化技術服務和技術轉移服務，促進創新資源向企業集聚，優化科技型中小企業創新創業環境。三是引導社會資本向初創期科技型中小企業投資。2007年，我部會同科技部設立科技型中小企業創業投資引導基金，通過階段參股、風險補助、投資保障等方式，專項用於引導創業投資機構向初創期科技型中小企業投資。

    經過15年的探索實踐，創新基金培育了一大批科技型中小企業，帶動了一批新興産業的興起和發展，為提升我國科技創新能力做出了積極貢獻。

    促進科技型中小企業提升技術創新能力。通過創新基金政策的實施，科技型中小企業的創新能力、知識産權意識及科技研發投入水平得到了顯著提高，涌現出一批創新能力強、發展潛力大、成長性好的科技型中小企業群體和技術領先、産品競爭力強、市場前景廣闊的創新型企業。據統計，2008-2012年，立項支持的21182家企業平均研發投入佔營業收入的比重達10.78%以上，遠高於創業板上市公司平均5%以及中小板上市公司平均2.5%的水平；截至2012年底，21182家企業已獲專利授權41196個，其中發明專利授權數為10357，軟體産品著作權10908項，軟體産品登記5177項。

    助推科技型中小企業快速發展。通過對立項前後企業發展各指標數據統計分析顯示，創新基金在促進企業成長、提升企業效益、增強企業綜合實力方面發揮了重要作用。截至2012年底，21182家企業實現年營業收入增幅超70%，平均每家企業增加1191.9萬元；企業年凈利潤增幅達79.29%，平均每家企業增加129.11萬元；企業年繳稅金增幅達66.65%，平均每家企業增加71.59萬元；企業年出口創匯額增幅達73.53%，平均每家企業增加14.33萬美元。

    提高企業産品化和産業化能力。創新基金為科技型中小企業從科技成果向現實生産力轉化提供了有力支撐，加強了科技成果研究、轉化、開發、産業化各市場主體的聯合與協作，縮短了科技成果的研發週期，提高了企業産品化和産業化能力。據統計，截至2012年底，創新基金資助的項目，已有12624項（佔59.6%）進入了批量生産階段，處於中試階段和研發階段的項目僅為8016項和542項，以上共約有85%的項目産品已進入市場形成收入。

    拓寬初創期科技型中小企業融資渠道。截至2012年底，引導基金共投入財政資金20.59億元，其中通過風險補助和投資保障方式累計安排資金8.5億元，支持249家創業投資機構，向1421家初創期科技型中小企業投資69.94億元，並對創業投資機構重點跟蹤服務的545家初創期科技型中小企業給予了直接資助。通過階段參股方式累計安排資金12.09億元，與社會資本共同設立了46家重點投資于初創期科技型中小企業的創業投資機構，累計註冊資金達83.8億元。2013年引導基金預算規模大幅增加，安排資金10億元，比上年增加一倍，以吸引更多社會資本投資于初創期科技型中小企業。