新華社武漢10月13日電(記者 沈翀)由我國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目取得階段性重大成果,項目組日前獲得了白菜全基因組的精細圖,甘藍和油菜全基因組的框架圖。
白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目于去年9月啟動,吸引了中國農科院、華中農業大學、湖南大學等多所國內研究機構以及韓、英、加、澳、美等國的相關研究機構科研人員參與,其中中國農科院蔬菜花卉研究所和油料作物研究所為項目主持單位。
油菜、白菜和甘藍同屬於蕓薹屬作物,油菜是由白菜和甘藍雜交後進化而來。其中白菜的基因組命名為A,甘藍的基因組命名為C,而油菜的基因組為AC。在測序技術路線上本項目採用了通量更高的新一代測序技術和全基因組鳥槍法測序策略,從而提高了測序效率。
研究表明,白菜、甘藍和油菜的基因組大小分別約為5億個、6.5億個和11億個鹼基對,白菜和甘藍含有的基因總數目分別約4.2萬個和4.5萬個,油菜基因覆蓋度為85%以上。
中國農科院蔬菜花卉研究所和油料作物研究所表示,對白菜、甘藍和油菜進行全基因組測序是國際上首次對三個近緣作物物種進行的整體測序,其中油菜是迄今首個全基因組測序的異源四倍體植物,這不僅對研究作物進化和遺傳改良有著重大意義,也對其他多倍體物種的全基因組測序具有重要的參考價值。
由於項目進展順利,在今年8月加拿大薩斯卡通召開的國際白菜基因組測序聯盟會議上,各成員國一致同意以我國的測序結果為標準序列,並將各自的數據整合到我國的白菜基因組圖譜中。
項目組介紹,下一步的工作將是繪製甘藍和油菜的基因組精細圖。