2005年，重點加強了湖泊污染控制與生態修復、城市水環境質量改善、飲用水安全保障，城市污水物化與生物水處理等技術體系的集成與應用推廣研究。形成了基於水體生態修復技術、河網面源污染控制技術和底泥治理技術的湖泊污染控制與生態修復技術體系，基於人工濕地技術、城市面源污染控制技術、城市污水處理與資源化新模式的城市水環境改善技術體系，基於水源水水質改善技術、水廠安全凈化技術、飲用水安全輸配技術的飲用水安全保障技術體系，基於生物處理技術、物化處理技術以及生物－物化聯用技術的城市污水處理技術體系。基本建立了一套覆蓋城市水環境、飲用水和排放污水的水安全保障技術系統與示範工程。

    在水源水污染突發事件應急處置方面，針對2005年11月發生的松花江污染事件，啟動了“松花江水污染應急科技專項”，重點圍繞“松花江污染江段多介質中硝基苯的分佈、遷移轉化與示範規律”、“受硝基苯污染松花江水強化處理應急技術”、“松花江水硝基苯污染對農牧漁業生産危害及其産品安全影響”、“松花江重大污染事件暴炸現場排水管線污染應急修復技術”、“跨界流域水環境綜合管理”和“松花江水污染應急科技對策與決策支持系統”等方面開展研究，為政府決策和污染治理提供科學依據和技術支持方案，併為其他類似事件的應對提供技術儲備。（科技部提供）