由於傳染病的傳播必須同時具備三個條件：傳染源、傳播途徑和易感人群 （宿主），即所謂的傳染鏈，因此，控制傳染病的蔓延也必須針對這幾個條件採取相對應的預防措施。

    控制傳染源

    學校要特別加強對食堂從業人員（包括水源管理人員）的管理，食堂從業人員每年必須進行健康檢查，取得健康證明後方可參加工作。凡患有痢疾、傷寒、病毒性肝炎（包括病原攜帶者）等疾病的，不得從事接觸直接入口食品的工作。食堂從業人員及集體餐分餐人員在出現腹瀉、發熱、嘔吐等病症時，應立即脫離工作崗位，待查明病因、排除有礙食品衛生的病症或治愈後，方可重新上崗。一旦發現或者懷疑有傳染病疫情發生時，學校要及時報告當地疾病控制部門及上級教育行政部門，並在疾病控制部門的指導下，迅速採取果斷措施，以做到早預防、早發現、早報告、早隔離、早治療。

    切斷傳播途徑

    為防止廁所對周圍環境及水源的污染，學校廁所建設應做到佈局與設計合理、衛生、安全、方便、實用，並達到糞便無害化處理的要求。獨立設置的廁所應與生活飲用水水源和食堂相距30米以上。廁所基地排水通暢，不易被雨水淹沒。學校供水設施要符合衛生要求，自備水源要定期進行消毒處理並加強監測。

    學校食堂應當保持內外環境整潔，食堂從業人員要有良好的個人衛生習慣。

    職業學校、普通中等學校、小學、特殊教育學校、幼兒園的食堂不得制售冷葷涼菜。

    保護易感人群

    學校要廣泛開展宣傳教育，使學生及教職員工了解痢疾、傷寒、病毒性肝炎等腸道傳染病的預防知識，提高師生員工自我防護能力。注射疫苗是保護易感人群的方法之一，現在很多傳染病可以通過注射疫苗來控制，其中包括甲型肝炎。需要對學校人群實施群體性預防接種的，必須按照《疫苗流通和預防接種管理條例》要求，由學校所在地縣級以上人民政府決定，並報省、自治區、直轄市人民政府衛生主管部門備案。任何單位和個人不得擅自組織學校人群進行群體性預防接種。