2006年，農業稅走進歷史博物館，農業特産稅徹底取消，煙葉稅條例制定出臺，標誌著國家和農民的傳統分配關係發生了根本性變革，扭轉了長期以來農民負擔過重的局面，邁出了統籌城鄉發展的新步伐，農村稅費改革取得了重要階段性成效。與改革前的1999年相比，2006年全國農民共減輕負擔約1250億元，人均減負約140元。為支持農村稅費改革，中央和地方在進行體制創新的基礎上，積極調整財政支出結構，不斷加大農村稅費改革轉移支付力度（見下表）。