2007年，水利部把水資源保護的工作重點放到了推進地方水行政主管部門開展本轄區水域納污能力核定和提出限制排污總量意見的工作，並提出區水功能區監管的具體要求。

　　一、要求水功能區劃已得到省級人民政府批准（批復）實施的省、自治區、直轄市水行政主管部門，按照《水法》的要求，將核定水域納污能力和提出限制排污總量意見的工作納入日常議事日程，作為一項重要的基礎工作來抓，切實抓出成效。

　　二、要求各省、自治區、直轄市水利（水務）廳（局）儘快開展上述工作，制定完成該項工作的詳細計劃，組織好技術力量，安排必要的工作經費，務必于2008年上半年完成該項工作。

　　三、各流域管理機構在已提出的限制排污總量意見的基礎上，根據本流域特點、經濟社會發展狀況，提出分年度限制排污總量意見。

　　四、要求各流域管理機構重點做好省界緩衝區的水資源保護工作。完成省界緩衝區監測、信息報告和通報、水質水量管理及應急預案、監督管理和標示等工作。逐步建立流域與省級地方人民政府及水利等有關部門的溝通和信息交流渠道。（水利部提供）