春節是兩岸民眾最重視的佳節，也是大陸航空運輸安全保障壓力最大的時段，尤其是上海、北京、深圳、廣州和杭州等繁忙機場空域及時刻資源異常緊張。儘管如此，大陸方面充分考慮到兩岸民眾對航空運輸的需求，克服困難，做了最大的努力。經海峽兩岸航空運輸交流委員會和台北市航空運輸商業同業公會充分協商後確定：按照以往春節包機慣例在大年初一及前後各14天，即2009年1月12日至2月9日這29天時間內，兩岸航空公司在執行原有常態包機的基礎上可再申請臨時包機。經多方協調，除上海航點保障因確有技術困難最大限度只能審批兩岸公司臨時增加班次量各20班外，其他航點增加航班計劃全部按公司申請給予保障，願盡最大努力滿足兩岸空運企業的包機需求。

    截至1月8日，大陸民航主管部門已受理兩岸12家航空公司（大陸7家、台灣5家）在春節期間增加包機的申請，其中：大陸執行常態包機的9家公司中，除川航、山航無春節增加包機計劃外，其他7家公司增加計劃執行61班往返包機，自大陸北京、上海、杭州、成都、昆明、廈門、福州、深圳、鄭州9個城市至台北桃園及松山2個機場，其中從上海始發20班、深圳始發6班、杭州始發15班。台灣5家公司增加計劃執行68班往返包機，自台北、高雄至北京、上海、深圳、廣州、杭州、廈門6個城市，其中至上海20班、至深圳15班、至杭州23班。