經衛生部醫師資格考試委員會2006年12月8日會議討論決定，2006年醫師資格考試醫學綜合筆試合格線分數為：

    臨床執業醫師：360

    臨床執業助理醫師：183

    口腔執業醫師：360

    口腔執業助理醫師：190

    公共衛生執業醫師：310

    公共衛生執業助理醫師：174

    具有規定學歷的中醫執業醫師：345

    具有規定學歷的中醫執業助理醫師：203

    師承或確有專長的中醫執業醫師：345

    師承或確有專長的中醫執業助理醫師：203

    具有規定學歷的蒙醫執業醫師：290

    具有規定學歷的蒙醫執業助理醫師：151

    師承或確有專長的蒙醫執業醫師：290

    師承或確有專長的蒙醫執業助理醫師：151

    具有規定學歷的藏醫執業醫師：305

    具有規定學歷的藏醫執業助理醫師：145

    師承或確有專長的藏醫執業醫師：305

    師承或確有專長的藏醫執業助理醫師：145

    具有規定學歷的維醫執業醫師：312

    具有規定學歷的維醫執業助理醫師：121

    師承或確有專長的維醫執業醫師：312

    師承或確有專長的維醫執業助理醫師：121

    具有規定學歷的傣醫執業醫師：271

    具有規定學歷的傣醫執業助理醫師：138

    師承或確有專長的傣醫執業醫師：271

    師承或確有專長的傣醫執業助理醫師：138

    中西醫結合執業醫師：378

    中西醫結合執業助理醫師：196