7月25日，國家防汛抗旱總指揮部發出《關於做好防禦第5號颱風工作的緊急通知》（以下簡稱緊急通知）。

    緊急通知説，今年第5號颱風“格美”7月24日23時45分在台灣省台東縣沿海登陸後，25日上午9時位於福建省晉江市東南方向約120公里的海面上，中心附近最大風力12級，正以每小時 15--20公里的速度向西北方向移動，預計25日下午到夜間在福建平潭到漳浦一帶再次登陸。24日晚，國家防總召開2006年第二次緊急辦公會議，專題研究部署防禦第5號颱風工作，國務院副總理回良玉作了重要講話。為貫徹落實這次會議精神，做好防禦第5號颱風工作，緊急通知要求：

    一、緊急採取避險措施。沿海地區要立即通知海上作業的各類船舶和人員回港避風，及時撤離和轉移危險地帶。低窪地區的人員，加固各類高空設施、廣告牌等。對颱風可能深入內陸地區，各級幹部要分片包乾，切實組織好山洪、滑坡和泥石流易發區群眾的轉移避險工作，確保人民群眾生命安全。

    二、強化預測預報。有關地區和部門要密切關注第5號颱風動向，加強颱風強度和走向的預測和滾動預報，一旦發現異常情況和災害徵兆，要及時作出預報和預警。特別是要利用電視、廣播等手段及時將颱風情況向群眾通報，做到家喻戶曉。

    三、確保大江大河防洪安全。各地始終要把大江大河防洪安全作為工作重點，認真落實防洪預案，強化措施，提前做好科學調度洪水的各項準備，充分發揮水利工程的防洪減災作用，突出重點，緊緊抓住查險和搶險兩個重要環節，對各種險情做到早發現、早報告、早搶護，確保大江大河防洪安全。

    四、確保水庫安全度汛。各地要把水庫安全作為防颱風的重要內容，特別是大型和重點中型水庫的安全要放在更加突出的位置抓緊、抓實、抓好。要加強各類水庫特別是病險水庫的管理，加強庫區雨水監測，掌握工程運行狀況，落實向下游報警的應急方案。一旦發生嚴重險情，立即通知下游群眾轉移，避免人員傷亡。各級防汛抗旱指揮部要加強督促檢查，嚴格按照水庫汛期調度運用計劃調度，落實應急搶險措施，確保水庫度汛安全。

    五、強化山洪災害防禦工作。各地要高度重視颱風帶來的強降雨引發的山洪、滑坡和泥石流等次生災害，及早做好山洪災害多發、易發區的監測預報，及時發佈山洪災害預警信息，做好群眾的宣傳教育工作，提高廣大群眾防災意識和自救能力。

    六、強化救災安置工作。南方有關省區一方面要抓好受災地區的救災工作，妥善安置好災民生活，搞好衛生防疫，組織受災群眾開展生産自救等，另一方面要做好防禦第5號颱風工作。其他地區要提前做好救災的各項準備工作。

    七、及時掌握和上報災情。各級政府和防汛、民政部門要高度重視災情的統計、核實和上報工作，要按照《國家防總防汛抗洪突發險情災情報告管理規定》，及時、全面、準確地掌握防汛抗洪突發險情和災情，並在第一時間上報。特別是涉及到人員傷亡、失蹤、被洪水圍困、無家可歸等災情信息，要及時上報。

    八、加強輿論宣傳工作。要通過新聞媒體及時宣傳各級黨委、政府和防汛指揮部對防汛抗洪和搶險救災工作的部署，宣傳基層黨員幹部和廣大群眾抗洪搶險救災的先進事跡，向廣大群眾傳播防汛抗洪救災信息，宣傳防洪避險的基本知識和應對措施等。