當全國人民正為第一幅月面圖片而歡欣鼓舞時，11月26日晚至11月27日晨，有效載荷兩台太陽風離子探測器、太陽高能粒子探測器和干涉成像光譜儀依次開機。干涉成像光譜儀運行正常，快視圖像和干涉條紋清晰；太陽高能粒子探測器科學數據正確反映月球空間高能粒子處於平靜狀態；太陽風離子探測器科學數據能道離子分佈明顯，方向分佈符合規律。

    11月27日23：23微波探測儀加電，並進行了參數調整，目前設備狀態正常，各個頻段觀測值符合預期規律。11月28日1：31激光高度計總電源加電，3：49激光開始測距，隨後進行了參數調整，初步獲得符合預期的距離信息。1：41 X射線譜儀加電工作，設備功能正常，低能探測器、高能探測器、太陽監測器能譜符合預期結果。3：58 γ射線譜儀加電工作，設備功能正常。

    截至目前嫦娥一號衛星上所有科學探測載荷全部開機，各載荷運行正常，對科學數據進一步的分析正在進行中。

    12月3日，中國科學院探月工程應用系統總體部在北京組織召開嫦娥一號衛星有效載荷在軌測試階段總結評審會。國防科工委月球探測工程中心，總裝備部航天指揮控制中心，航科集團五院，中科院高技術局、國家天文臺、空間中心等單位的有關專家組成了評審委員會。評審委員會聽取了各載荷的在軌測試總結報告，一致認為：有效載荷在軌測試期間，各設備工作正常；對下行的科學數據符合預期的指標要求，可以轉入長期管理運行階段，開始科學探測。