5.12汶川特大地震發生後，農業部部長孫政才立即指示，由國家首席獸醫師賈幼陵率隊，抽調農業部獸醫局、畜牧業司、中國動物疫病預防控制中心和中國獸醫藥品監察所等單位多名專家，成立農業部抗震救災防疫專家組，迅速奔赴災區，指導並協助當地畜牧獸醫部門迅速開展消毒和無害化處理等抗震救災工作。

　　救災如救火。為保證抗震救災工作順利推進，農業部加強防疫應急物資調撥，協調四川省畜牧食品局，落實抗震救災防疫應急物資。截至5月19日，共落實防疫抗震救災專項資金1000萬元，其中500萬元專門用於災區死亡動物無害化處理工作。同時，按照“需要多少、調撥多少，就近供應、滿足需要”的原則，及時發動獸藥企業捐贈消毒藥品127噸，組織調撥消毒藥品498.5噸；組織調撥機械噴霧器376台和手動噴霧式消毒器械2687台；協調草原防火儲備庫，緊急調運軍用帳篷100頂。部分地區調撥的防疫應急物資被當地政府徵用，如德陽什邡市5噸消毒藥品和10套機械消毒器被徵用，用於軍隊抗震救災。

　　5月17日，針對重災區基層畜牧獸醫系統人員傷亡較重，無力及時有效開展消毒和無害化處理工作，農業部專家組聯合四川省畜牧食品局，調配107人組成防疫應急分隊，分4組分別奔赴都江堰市石羊鎮和彭州市白水河鎮、德陽的綿竹市東北鎮和什邡市師古鎮，積極配合有關部門，帶動當地群眾全面開展無害化處理工作。同時，農業部專家組還動員各災區縣市成立防疫應急分隊，積極投入消毒滅原工作。截至5月18日，共組織防疫應急分隊1846支，隊員7637名。

　　目前，除四川阿壩州的汶川、茂縣和禮縣，綿陽的北川和廣源的青川等5個重災區市縣因交通管制無法開展工作外，災區各市縣都在按照“由外向內”的原則，有序開展無害化處理和環境消毒工作。全省無害化處理死亡大牲畜已達74.58萬頭/只，禽兔515.28萬隻。消毒災區圈舍7579.87萬平方米，清理受災畜禽規模養殖場（小區）1.09萬個，佔受災場（小區）數的57.4%。

　　根據災區實際需求，農業部專家組確定“兩手抓”：一手抓救災防疫，一手抓對口援助。在全力開展無害化處理和消毒防疫的同時，農業部專家組積極建議四川省畜牧食品局安排專項資金，緊急採購礦泉水、牛奶、餅乾、方便麵，並啟動草原防火物資庫，調運大帳篷、睡袋等救災生活基本必需品，送往綿陽、德陽、成都、廣元等受災市州，幫助災區畜牧獸醫系統開展自救和互救工作。按照這一思路，四川各市州紛紛建立對口援助制度，德陽市畜牧食品局組織中江、羅江兩縣援助重災區綿竹市，廣漢市、旌陽區援助重災區什邡市。

　　死畜死禽要處理，活畜活禽也要加強管理和處理。目前，災區市縣政府積極組織地方屠宰加工企業收購存活畜禽，或轉移災區存活畜禽異地飼養，減少了災區養殖戶損失，減輕了當地政府壓力，得到受災養殖戶的支持。德陽市指揮部協調解決畜禽收購資金2400萬元，用於當地屠宰加工企業收購災區存活畜禽。據農業部專家組現場考察，一頭生豬交易價為1050元，受災養殖戶比較滿意。

　　災區救災防疫，消毒藥品和疫苗供應至關重要。為此，農業部專家組先後到四川潔康消毒藥品有限責任公司、中牧實業股份有限公司、成都藥械廠實地考察，慰問地震災害企業，調研消毒藥品和疫苗生産儲備情況，就災區急需的消毒藥品、人畜共患病和重大動物疫病疫苗生産庫存情況，以及就消毒藥品大包裝生産、除屍臭和滅菌效果等問題與企業進行了座談，要求企業要增強社會責任感，強化救災物資生産質量管理，保證産品質量，滿足動物疫病防控需要。會後，農業部專家組及時與有關部門協調，促進解決企業生産供應中存在的實際困難和問題。

　　農業部專家組還積極與衛生部抗震救災工作組加強溝通和合作，一方面加強信息交流，實現消毒藥品、高壓消毒器械等防疫物資資源共享，另一方面實行聯合作業，共同開展環境消毒。衛生部門在重災區核心地帶對人遺體和動物屍體實現由內向外全面消毒，農業部門則由外向內，在人員救治基本結束後，立即跟進消毒和無害化處理，全面提高防控效果。