新華社武漢3月21日電(記者李鵬翔、俞儉)華中農業大學21日對外公佈了甜橙全基因組序列圖譜。華中農大的園藝學、基因組學、生物信息學科研人員,經過一年多的努力,破解了甜橙基因“密碼”,完成了甜橙基因組拼接與註釋,獲得了較高質量的甜橙基因組。這是中國自主完成的第一個果樹作物基因組序列圖譜,也是世界上目前最為完整的甜橙全基因組序列圖譜。
課題牽頭人、中國工程院院士、國家柑橘産業體系首席科學家、華中農業大學教授鄧秀新説:“這標誌著我國在生物技術和功能基因組合上搭建起一個很好的科研平臺,也對促進柑橘的品種改良,全面提升産業競爭力具有重要意義。”
甜橙是世界第一大柑橘類型,産量佔全世界柑橘産量的60%。我國是世界上重要的柑橘原生中心,2010年中國總産量2645萬噸,是世界柑橘第一生産大國。
華中農業大學博士徐強介紹説,甜橙具有多胚、雄或/和雌不育、遺傳背景高度雜合等特點,阻礙了遺傳學及育種的發展。完整的基因組信息,作為一個遺傳框架,將為柑橘遺傳與育種改良提供科學的依據。
華中農業大學此次甜橙基因組測序採用全基因組鳥槍法(WGS)策略,進行雙末端測序,得到數據總量約為200G,拼接後的序列覆蓋87%的柑橘基因組,獲得註釋的基因近3萬個。
鄧秀新説,甜橙基因組序列圖譜的完成,如同打開了甜橙生命活動的“黑匣子”,破解了甜橙基因“密碼”,得到了基因組合的排列順序和相關特徵。對於今後研究中,有意識地鎖定甜橙成熟期、色澤、含糖量、産量、抗病性等農藝性狀提供了良好的基礎,有利於培養出更好、更健康的品種來。
此次甜橙全基因組序列圖譜使中國在柑橘基因的基礎研究上與國際接軌。“這為中國將來的生物技術發展提供更多的可能,也有利於打破國外對中國的一些技術封鎖。”鄧秀新説。21日,甜橙基因組網站(http:// citrus.hzau.edu.cn)已經上網,面向國內的專家學者,為學術研究提供免費數據分析。