與香港特別行政區的交流與合作
2003年邀請、接待香港教育界的愛國社團、辦學團體、教授、中小學骨幹教師、青少年學生領袖等22個團組，約1200人次，到內地訪問考察和交流。舉辦了第十屆“華夏園丁大聯歡”活動，第一次邀請到台灣地區及新加坡華語學校的中小學教師與香港、澳門、內地的教師300人在江蘇省境內交流、聯歡。組織青少年學生到延安、西昌衛星發射中心參觀，安排香港的大學生到北京、上海、深圳、廣州、江蘇等地做畢業實習。委託北京師大、華東師大、南京師大和華南師大分別為香港的中小學校長、幼兒園園長、教師舉辦教育改革和國情考察研修班。
鼓勵和支持內地高校與香港高校開展合作辦學。經教育部批准，在內地舉辦的有關工商管理、現代物流、國際房地産等專業的合作辦學項目17個；在香港舉辦的有關中醫、中藥、普通話教學等方面的合作辦學項目7個。
積極吸引香港地區青年學生到內地求學。內地高校招收香港本科生1487名，研究生228名，預科生800名，插班生41名。內地11所高校為香港八所大學代招本科生144名，香港8所大學在內地招收自費生338名。
從2003年7月1日起，內地人員赴港就讀、任教、合作研究及高級勞務人員所持證件，由因公改為因私。
加強與香港地區教育主管部門的溝通，建立高層互訪機制。2003年6月香港特別行政區教育統籌局局長李國章訪問教育部。教育部副部長章新勝於2004年1月訪問了香港教統局。
香港愛國人士及基金會資助內地教育捐款
2003年，香港邵逸夫基金會繼續向內地提供第16批教育贈款2億港元，用以重點支持西部教育事業發展，共捐助內地378所大中小學校建設教學樓、圖書館等。
霍英東教育基金會自2003年起，依據國民經濟與社會發展需要，增加設立“優選資助課題”，用以資助在能源、信息、交通、材料、生命、環境等六個學科領域有重要應用前景或能産生重大經濟和社會效益的研究課題32項，共提供64萬美元的科研經費。同時，霍英東教育基金會討論確定了2003年第九屆高等院校青年教師基金及青年教師獎獲得者共273名，提供獎金及科研經費210.91萬美元。
2003年12月，為慶祝教育部與李嘉誠基金會西部農村中小學現代遠程教育項目10000個教學示範點的建成，陳至立國務委員和李嘉誠先生出席了由教育部舉行的新聞發佈會。該項目的實施，對農村現代遠程教育起到了積極的示範推動作用。李嘉誠基金會為該項目提供了1.2億元人民幣的捐款。
曾憲梓教育基金2003年出資630萬元人民幣，資助1750名貧困大學生在全國35所高校就讀。此外，華夏基金會、王寬誠教育基金會、田家炳基金會、周凱旋基金會、方樹福堂基金會等繼續支持內地教育事業發展，分別資助和獎勵優秀的貧困大學生或女大學生完成學業，資助高等院校舉辦國際會議或出國參加國際學術會議，支持內地職業技術教育發展和高中課程課程改革研究等項目。同時，2003年，新設立邵方逸華獎學金，幫助西部部分貧困地區學生完成中等職業技術培訓，以期通過他們帶動西部貧困地區脫貧致富。
據不完全統計，截至2003年底，教育部接受的來自香港的教育基金會和愛國人士的教育捐款共計22888.3萬元人民幣，各項教育捐款極大地促進了內地，特別是西部教育事業的發展。
與澳門特別行政區的交流與合作
2003年邀請並接待了7個澳門教育團組，密切了兩地教育界間的聯絡，促進了教育交流與合作；向澳門3所愛國學校贈送了價值10萬元人民幣的內地圖書；為澳門中小學校長分別舉辦了研修班；接待了澳門特區政府社會文化司司長崔世安（副部級）先生一行；與澳門特區政府高等教育輔助辦公室和教育暨青年局建立了定期交流溝通機制；批准內地高校與澳門合作辦學項目6個；邀請80名澳門中小學教師來內地參加“華夏園丁大聯歡”活動；內地高校招生宣傳團赴澳門舉辦招生宣傳，介紹內地高校情況，並招收120名保送生；澳門大學、澳門理工學院、澳門科技大學、澳門旅遊學院等澳門的4所高校在內的14個省、自治區、直轄市招收全日制自費生784人，其中本科生483人，預科生75人，研究生226人；內地高校招收澳門研究生326人，本科生1296人，預科生138人，插班生3人。
與台灣地區的交流與合作
2003年組織了個兩岸大學生交流活動和兩岸學者參加的學術研討會等交流項目30個，參加上述活動的台灣研究生、大學生，專家學者近1000人；委託吉林大學舉辦了台灣學生“北國風情冬令營”活動，有90名台灣大學生和30名祖國大陸大學生參加活動；邀請並接待了兩個台灣教授訪問團共130余人；協助中央電視臺舉辦了由兩岸高中學生參加的“第二屆海峽兩岸知識大賽”活動；首次邀請13名台灣中小學教師參加了在南京市舉辦的“華夏園丁大聯歡”活動；祖國大陸的10余所大學與台灣的大學簽訂了校際交流協議，為兩岸大學間開展對口交流奠定了堅實的基礎；教育系統應邀赴臺交流人員為2200人次，包括教師、專家學者、教育行政管理人員、大學生、研究生等，交流的內容為參觀、考察、參加學術研討會、講學、合作研究、參加兩岸大學生交流營等。
祖國大陸高校招收台灣研究生905人，本科生703人，預科生157人，插班生167人。
