按照11月3日全國防控高致病性禽流感指揮部全體會議和11月6日國務院全國防控高致病性禽流感電視電話會議精神，鐵道部立即成立了由部黨組書記、部長劉志軍任組長，黨組成員、副部長胡亞東和總調度長吳強任副組長的鐵路防控高致病性禽流感領導小組，組建了運輸防控組、運輸保障組、防疫指導組和宣傳綜合組，建立了工作制度，明確了分工和職責。全路18個鐵路局和3個專業運輸公司也成立了防控禽流感工作機構。在鐵道部領導小組統一部署下，全路迅速展開工作，全面落實各項防控措施，堅決阻斷疫情通過鐵路傳播。

    一是暢通信息渠道。鐵路各級防控機構實行24小時晝夜值班，及時掌握疫情情況。建立防控信息體系，明確逐級報告的內容和渠道，一旦發生疫情，第一時間上報，並立即啟動應急預案。加強與農業部、質檢總局、國家發改委等有關部門及各級地方政府的溝通協調，及時了解掌握地方防控工作動態，積極支持和配合地方政府做好防控工作。

    二是切實做好鐵路各環節防控工作。嚴把鐵路口岸防控關，配合檢驗檢疫機構，嚴格進出境列車、車輛和人員攜帶物品的檢查，對禁止入境貨物進行封鎖隔離，防止未經檢驗檢疫的動物及其産品進出境。嚴把旅客列車防控關，做好來自疫區的鐵路運輸工具的檢疫、消毒工作，搞好旅客攜帶品和行李車運輸的檢查，規範站車餐料進貨渠道。嚴把貨物運輸防控關，嚴禁承運無檢驗檢疫證明的動物及其産品。嚴把鐵路飼養禽類防控關，對鐵路多种經營系統飼養的禽類一律實行強制免疫，免疫密度要達到100%。

    三是對疫情地區實行重點防控。對已經發現禽流感疫情的地區，鐵路部門緊急採取相應措施。在遼寧省黑山縣出現禽流感疫情後，鐵道部自11月8日停止了疫區內黑山、八道壕、芳山鎮、新立屯、小梁山、小東、姚堡、唐家、繞陽河、大虎山、高山子、青堆子、溝幫子等13個車站的動物、動物産品始發、中轉和終到業務。11月9日至15日，遼寧省阜新縣、錦州市和湖北省京山縣、安徽省淮南市、新疆維吾爾自治區澤普縣、烏魯木齊縣相繼發生禽流感疫情後，立即與有關單位聯絡，對瀋陽、武漢、上海和烏魯木齊鐵路局防控工作進行重點佈置。

    四是堅持特事特辦，確保防控物資運輸。把防控物資運輸作為重中之重，特事特辦，急事急辦，做到優先承運、及時挂運、重點掌握，以最快速度送達。加強與哈爾濱、遼陽、鄭州、青島、濟南、廣州、南京、成都等禽流感疫苗生産地相關部門和廠家聯絡協作，隨時掌握運輸需求，提前安排運輸計劃，並及時承運、登記和報告。