5月22日上午，人們還沉浸在對四川汶川大地震中遇難同胞的哀悼中，承載著我國大洋考察第20航次任務的“大洋一號”船首批66名船隊員，又滿懷著 “與祖國同命運，為人類探大洋”的豪情踏上了探索大洋的新征程。
起航儀式在廣州長洲——中國海監第八支隊碼頭舉行。中國大洋協會理事長、國家海洋局副局長王飛，外交部條法司徐宏副司長，廣州市人民政府陳明德副市長，海軍廣州基地吳倣春司令員和財政部、中國地質調查局等相關部門的領導為船隊員們送行。
大洋科考第20航次計劃時間250天，航程約3.4萬海裏，分為6個航段實施，預計2009年1月26日返回青島。本航次調查區域涉及西太平洋、東太平洋、西南太平洋和西南印度洋。主要目標是在大洋科考第19航次的基礎上，重點對西南印度洋中脊我國首次發現的活動熱液噴口區開展多學科的綜合性調查，了解熱液區的地質、地球物理特徵及海底熱液硫化物的分佈，並在噴口區周邊尋找新的熱液異常；同時開展洋中脊區域的環境和生物多樣性研究，重點調查超慢速擴張脊微生物多樣性及生物地理分佈；在東太平洋海隆進行調查並驗證熱液異常，力爭發現新的熱液活動區。
本航次由國家海洋局第二海洋研究所具體組織實施。共有來自國內外24家科研、教育院所的145名科技人員參加。除了參加單位和人數多、範圍廣之外，它的另一個顯著特點是技術手段高，將採用許多自主研發的高技術新設備。如3500米的深海觀測和取樣型無人遙控潛水器（ROV）、近底聲學和光學深拖探測系統、生物取樣器、可視箱式取樣器、淺底層岩芯鑽、電視抓鬥以及深海觀測錨係系統等，其中自主設計的ROV和深拖系統是第一次使用。
起航儀式上，甄松剛船長還將凝聚著66名船隊員對災區人民牽掛和愛心的3.36萬元捐款交給了中國大洋協會辦公室黨委書記張利民轉交災區。
