2006年春運工作從1月14日到2月22日，共40天。東航除兩岸春節直航包機外，計劃安排各類加班、包機共623班，其中緊貼市場需求熱點的臨時加班包機共403班，固定加班223班。所有加班包機計劃如獲得批准，航班在本月月底前即可進入電腦銷售系統，方便廣大客戶及時查詢。
此外，東航將於1月25日至2月5日期間，執飛10個往返、20個班次的"上海-台北-上海"航班。為圓滿完成此次兩岸春節直航包機任務，東航將最豪華也是世界最長的寬體客機A340-600及強大的機組陣容編入飛行計劃，同時還考慮將最新機型A330飛機投入節後台北航線運營。
為確保2006年春運工作"安全、有序、暢通"，東航在飛行技術、航線機務、市場銷售、空地服務、地面保障等各方面作了精心部署和充分準備。要求航班保障和運行各部門加強協作，積極準備，針對冬季航班的運行特點，做好防/除冰工作，加大飛機檢修力度，嚴密監控飛機狀況，加強駐外機組管理，尤其特別強調了對兩岸直航包機的保障工作。
同時，東航為2006春運服務工作專門定制的改良唐裝制服也于2005年12月22日在上海虹橋機場正式亮相。這套唐裝制服由織錦緞做成，衣領比一般唐裝稍高，一排別具特色的盤扣扣住兩襟，上裝分大紅、明黃和粉紅三色，飾有中國傳統的"雙飛蝶"圖案，下裝為黑色中裙，裙邊繡有彩蝶。其中，大紅和明黃色唐裝在2005年初臺商包機期間給台灣同胞留下了深刻印象，這一次東航又新添了粉紅色唐裝，以體現中國江南文化靈秀婉約的一面。2006年春運期間，除了東航空姐將身穿唐裝為旅客提供服務以外，東航頭等艙、公務艙候機櫃臺和貴賓廳的地姐們也將穿上這套唐裝，用精湛的服務迎送來自五湖四海的旅客。
