為加強藥品質量監督，打擊假劣藥品，確保公眾用藥安全，重慶市充分發揮藥品檢驗的技術保障作用，科學制定藥品抽驗計劃，對抽驗不合格率上升的中藥飲片、中藥材和抗生素適度提高抽驗比例；加大對農村地區藥品監管的力度，增大了對三峽庫區和渝東南地區的抽驗批次。對上年抽樣不合格的生産經營企業和醫療機構，全部納入追蹤抽樣的範圍，切實保證了對本地生産企業評價性抽樣的全覆蓋，以及監督抽樣的針對性。

    截至目前，重慶市藥品檢驗所、萬州藥品檢驗所、涪陵藥品檢驗所共檢驗送檢藥品5584批，不合格685批，總不合格率為12.27%。其中，評價抽驗1125批，不合格29批，不合格率為2.6%。與2004年3.4%的不合格率相比，下降了0.8個百分點；監督抽驗4459批，不合格656批，不合格率14.7% 。與2004年27.7%的不合格率相比，下降了13個百分點。重慶市上市藥品的質量明顯好轉，藥品質量狀況整體良好。