6月25日，福建省衛生廳通報了出入境檢驗檢疫機構發現並轉交2例甲型H1N1流感確診病例，分別是福建省第62例、第64例確診病例。6月26日，國家質檢總局通報了所屬福建檢驗檢疫局在入境檢疫時發現上述2例病例並及時轉交地方衛生部門隔離診治的經過。
通報説，第62例患者，女性，13歲，美國籍。患者隨母親于當地時間6月17日從美國華盛頓乘AC313航班前往加拿大多倫多，轉乘AC015航班于6月18日抵達香港，6月22日16時58分患者乘MU576航班抵達福州長樂國際機場。17時03分，福建檢驗檢疫局檢疫人員開始登機檢疫，體溫檢測發現該患者腋下體溫為37.8℃。檢疫人員立即採取防護措施，引導患者至專用檢疫排查區進行流行病學調查和醫學詢問。患者經復測，體溫為37.5℃，回答醫學詢問時，自訴發熱1天，在香港登機前服用過感冒藥，感覺咽幹。患者及其母親再次聲明其除發熱外無其他不適，未與流感或有流感樣症狀的患者有過密切接觸。鋻於該患者來自有疫情發生的國家，且有發熱等相關症狀，檢疫人員初步判斷其有染疫嫌疑，立即將其移送長樂市醫院進行隔離治療。
第64例患者，女性，7歲，美國籍，是福建省第54例甲型H1N1流感確診病例的妹妹，兩人與福建省第49例確診病例同機入境。患者隨親屬從美國紐約乘坐CX841航班至香港，在香港轉乘KA662航班，並於北京時間6月17日19時02分抵達福州長樂國際機場。患者在機上、檢疫通道二次測溫，體溫均正常，入境健康申明卡申明無任何不適。鋻於本患者是福建檢驗檢疫局發現的發熱病人（後被確診為福建省第49例、第54例確診病例）的密切接觸者，檢疫人員將其轉交當地衛生部門進行醫學觀察。6月22日，患者出現發熱症狀，被當地衛生部門用救護車送至馬尾開發區醫院隔離治療。
據福建省衛生廳通報，福建省和福州市疾病預防控制中心分別對上述2例患者的咽拭子標本進行檢測，結果均為甲型H1N1流感病毒核酸陽性。福建省衛生廳組織專家進行會診，判定這2例患者為甲型H1N1流感確診病例。
