2006年7月1日，新疆維吾爾自治區政府公文無紙化傳輸系統投入應用。自治區政府、政府辦公廳下發的正式文件（維、漢文）將以電子公文方式通過公文無紙化傳輸系統發送至自治區各地州市政府（行署）、自治區政府各部門、各直屬機構及相關機構約100余家單位，相應的紙質公文停止發送，這標誌著高效的無紙化辦公在自治區政府正式啟動，新疆自治區地處邊遠、地域遼闊、交通不便，現代化的電子公文傳輸系統的建設和應用是對傳統公文交換傳送方式的革命性變革，將大大提高自治區政令傳送時效，促進政府工作效率的全面提高，其意義重大，影響深遠。

    新疆自治區政府公文無紙化傳輸系統是指通過自治區政府辦公廳統一配置的設備，通過採用數字簽章和加密保護技術，進行電子公文生成、發送、接收處理，實現帶紅頭印章的政府公文網絡傳送控制打印復原的系統，是全國同類項目中第一個實現地方少數民族文字政府公文與漢文同時電子化傳送的系統。

    新疆自治區政府公文無紙化傳輸系統依託于自治區人民政府電子政務專網，以自治區政府辦公廳為樞紐，縱向聯接各地州市人民政府、行政公署，橫向聯接自治區人大辦公廳、政協辦公廳、兵團辦公廳，自治區人民政府組成部門、直屬單位、人民團體、大專院校，中央駐疆單位及自治區大型企業等，是基於統一的自治區電子政務專網的電子政務全局性重點應用建設項目。

    自治區人民政府領導給予政府公文無紙化傳輸系統項目建設高度關注和大力支持，自治區人民政府辦公廳積極組織、認真規劃，將系統建設和應用作為2006年全區電子政務工作的重點，制定並印發了自治區政府公文無紙化傳輸系統建設指導方案和技術實施方案。按照自治區政府系統公文無紙化傳輸系統建設工作指導方案，2006年3月14日，自治區人民政府辦公廳根據政府採購法的規定程序，組織進行了項目建設招標活動，本著公平、公正、科學、擇優的原則，確定北京北大方正電子有限公司和新疆西北星信息技術有限公司等企業為新疆自治區政府系統公文無紙傳輸系統項目第一期建設的承擔企業。從2006年4月起，系統進入全面建設階段。

    2006年4月和5月，自治區人民政府辦公廳分別舉辦了2期自治區政府公文無紙化傳輸系統培訓班，共培訓100余家重點地區和單位主管領導和應用及技術人員300多人。經過兩個多月的努力，列入第一期公文無紙化傳輸系統建設計劃的地區和單位基本完成了應用培訓和設備安裝調試工作，從5月下旬開始進行了為期一個月的應用測試運行。在測試運行期間，自治區政府辦公廳針對各地各單位在應用測試中出現的問題進行了協調指導，並由辦公廳秘書一處和政府辦公自動化中心組織對部分廳局和州市進行了現場指導和督促檢查。經過應用測試，參加第一期建設的絕大多數地區和單位都完成了應用測試的相關工作，電子公文接收和上報操作及格式符合要求，短信手機開機和信息接收狀態良好，公文處理規範及時，具備了正式開展公文無紙化傳輸應用的條件。

    自治區政府公文無紙化傳輸系統的啟用，意味著新疆自治區政府公文無紙化傳輸系統第一期建設完成，標誌著自治區政府系統在推進現代化辦公、提高工作效率和工作水平方面又邁出了重要而有歷史意義的一步，自治區電子政務建設和應用有了新的重大進展。自治區政府辦公廳在第一期應用全面啟動後，將開始組織第二期的建設和應用，在年底前全面完成全區政府系統公文無紙化傳輸系統的建設和應用工作。