為了進一步減輕企業和群眾的負擔，保持經濟持續較快發展，按照國家關於取消和停止徵收100項行政事業性收費項目的通知要求，經清理，重慶市2009年行政事業性收費項目共194項，比2008年減少64項，已經重慶市政府公佈執行。在中央取消和停止徵收100項中，涉及重慶市應取消的行政事業性收費項目42項，具體如下：

    1、收費許可證費

    2、煤炭生産許可證工本費

    3、義務教育階段雜費

    4、義務教育階段借讀費

    5、學位與研究生教育評估費

    6、國家普通話水平等級證書工本費

    7、高校保送生綜合能力考試考務費

    8、邊防檢查證件工本費

    9、暫住人口管理證工本費

    10、珠算證書工本費

    11、會計人員從業資格證書費

    12、註冊會計師全科合格證工本費

    13、專業技術資格證書工本費

    14、職業資格證書工本費

    15、工程定額測定費

    16、建設工程質量監督費（含交通、水利）

    17、航海專業培養費

    18、船員適任證書工本費

    19、獸藥生産許可證工本費

    20、獸藥經營許可證工本費

    21、畜禽及其産品防疫費

    22、護士註冊費

    23、執業醫師註冊費（含執業醫師證書費）

    24、新資源食品（保健品）申請審評費（含藥監部門保健品）

    25、衛生許可證費

    26、母嬰保健技術收費

    27、醫師資格證書費

    28、《出生醫學證明》工本費

    29、事業單位登記費

    30、廣告經營單位註冊登記費

    31、經濟合同示範文本工本費

    32、職業、礦山安全衛生檢驗費

    33、醫療器械生産准許證審查費

    34、醫療器械新産品鑒定費

    35、證券、期貨從業人員資格證書工本費

    36、保險代理人資格證書工本費

    37、保險經紀人資格證書工本費

    38、保險公估人資格證書工本費

    39、貨物進出口證書工本費

    40、單證收費

    41、外國專家證工本費

    42、導遊證IC卡工本費

    在取消以上收費項目基礎上，重慶還取消了其他部分行政事業性收費項目6項：

    1、公路養路費

    2、內河航道養護費

    3、公路運輸管理費

    4、水路運輸管理費

    5、個體工商戶管理費

    6、集貿市場管理費

    為了最大限度的減輕企業和群眾的負擔，經進一步清理，重慶市對年收費金額5萬元以下的收費項目及其他部門地方行政事業性收費項目19項予以取消，具體如下：

    1、酒類生産許可證工本費

    2、房屋産權證書工本費

    3、下水道接溝許可證工本費

    4、停車樓（場）牌照工本費

    5、終局司法鑒定費6、防火檔案費工本費

    7、乘機證明、乘機住宿證明工本費

    8、機場限制區出入證工本費

    9、船舶戶口簿工本費

    10、船舶戶牌工本費

    11、人事爭議仲裁費

    12、攝像製品經銷、放映許可證工本費

    13、有線電視系統工程質量鑒定驗收費

    14、規劃證書工本費

    15、體育經營許可證

    16、專業崗位證書工本費

    17、蠶桑生産技術改進費

    18、統計從業資格證書工本費

    19、農村土地承包經營權證工本費

    在中央取消和停止徵收100項中，涉及重慶市應停止執行的行政事業性收費項目2項，具體如下：

    1、種子生産、經營許可證工本費

    2、藥品監督許可證收費

    經進一步清理，重慶市對以下7項年收費金額5萬元以下的收費項目及其他部分行政事業性收費項目停止執行：1、外商投資場地使用費 2、仲裁費3、星級標牌工本費4、入境簽證費5、測繪儀器測試收費6、特種勞動防護用品檢驗費7、一般勞動防護用品檢驗費

    經過這次清理，重慶市總共取消行政事業性收費項目67項（其中一級項目55項，二級項目12項），停止執行9項。