上海海關採取系列措施支持長江黃金水道建設，重點提高中轉、轉關貨物通關效率，吸引更多貨物通過長江水路進出上海口岸。同時，推廣“同船運輸內、外貿集裝箱貨物”的內支線管理模式，提高沿海、內河水道航運資源使用效率；探索將水路轉運優勢延伸到長江沿岸附近地區的有效方法，解決長江支線船舶與靠泊洋山港大船間銜接問題；積極推進長三角區域通關改革試點，進一步整合口岸和內地海關的管理資源。