各地海關根據海關總署部署，積極投身抗震救災工作中。

    成都海關關員堅守崗位，高效做好海關日常業務工作，維護良好工作秩序，積極支持抗震救災。5月12日雙流機場自地震發生後關閉，至當晚21時重新啟用。雙流機場海關旅檢關員立即做好進出境航班及旅客行李物品的驗放工作，保證進出境通關順暢。直到13日淩晨，共驗放進出境航班8班，進出境人員1000余人。在抗災捐贈物資進口驗放中，成都海關嚴格貫徹執行海關總署要求，特事特辦；變24小時預約通關為24小時無間斷通關，開設驗放專窗，保證救災物資迅速及時驗放。目前，成都海關已組織22人救援突擊隊立即趕赴都江堰、綿陽海關組織10名青年關員救援隊立即趕赴災情最嚴重的北川縣救援。

    5月14日上海海關接到武警浙江省消防總隊關於一批抗震救災物資的減免稅審批的申請，物品有價值8萬美元的起重氣墊15個；價值2.6萬美元堵漏袋10個；價值1.1萬美元堵漏槍4個。海關立即為其辦理了減免稅手續，全力配合做好四川省汶川縣抗震救災的相關工作。此前，上海海關已于13日緊急開闢“綠色通道”為上海克莉絲汀食品有限公司向四川災區援助的價值30萬人民幣的食品提供通關便利，進行快速驗放。

    5月13日下午，北京首都機場海關快速驗放首批抗震援災物資，該批物資為中國交通通信中心進口的100套海事衛星設備，這是地震災情發生以來從北京空港口岸進口的首批援助物資。