2008年，福建省計劃投資9.96億元對閩江流域水環境開展綜合整治，重點推進五大工程98個項目：

    一．加快畜禽養殖污染整治。取締禁建區劃定後建設的養殖場和禁建區劃定前建設但于2006年底前仍未治理達標的養殖場，防止出現污染反彈。大力推廣生物發酵舍“零排放”養殖技術。

    二、加大環保基礎設施建設力度。認真落實省政府推進城市污水、垃圾處理産業化發展的政策，重點解決污水管網和生活垃圾收運設施的配套和完善。計劃投入5.57億元，重點實施福州大學城污水處理廠擴建、閩侯縣等6個污水處理廠項目和長樂市、武夷山市等2個污水處理廠管網配套工程等。

    三、做好重點水源保護。嚴格執行飲用水源保護區劃定方案，計劃投入0.26億元，重點實施長樂炎山水源地等7個水源保護項目。

    四、加強工業污染防治。依法督促經省環保與經貿部門共同確定的開展清潔生産企業按期完成清潔生産審核。計劃投入2.77億元，重點實施福州富成味精食品有限公司搬遷整治等44項污染防治和清潔生産項目，加快循環經濟、生態工業園區發展。

    五、促進生態建設。推進礦山整頓、生態林保護和自然保護區、梯級水電站等清理整頓，大力推進農村生活污染治理。計劃投入0.67億元，重點實施光澤縣大坑螢石浮選廠治理等22個項目。

    整治的主要目標是：閩江流域省控監測斷面水質功能區達標率90%以上。城市集中式飲用水水源地水質基本達到功能要求，福州市、南平市、三明市集中式飲用水水源地水質達標率達95%以上，各市縣集中式飲用水水源地水質達標率達85%以上；各市、縣（區）完成COD總量削減目標。