2008年6月9日，科學技術部與重慶市人民政府在重慶召開了部市工作會商第二次會議。這是雙方深入貫徹落實科學發展觀和胡錦濤總書記為重慶發展作出的總體部署，探索更加緊密的合作模式，共同推進區域創新體系建設的又一具體行動。

    全國政協副主席、科技部部長萬鋼，重慶市委副書記、市長王鴻舉，市委常委、宣傳部部長何事忠，副市長童小平，市政協副主席吳家農、陳萬志，科技部副部長尚勇，副秘書長王志學，重慶市委副秘書長周傳航、市政府副秘書長羅廣以及科技部和重慶市有關部門負責人出席了會議。王鴻舉市長、萬鋼部長作了重要講話。科技部副部長尚勇主持會議。

    去年雙方進行了第一次工作會商，在雙方主要領導的直接關心下，重慶科技創新取得了重要進展，圍繞一批重大科技問題，雙方合作取得富有成效的成果。在此基礎上，今年會商雙方圍繞共建以高新技術産業為核心的重慶北部新區、推進科技金融結合試點、推動節能減排科技創新、推進城鄉統籌發展科技創新和推進區域科技創新平臺建設等五個議題進行了會商,達成了共識，並原則同意今年雙方重點推進高新區、經開區、北部新區優勢集成和創業風險投資引導試點工作，推動實施海上風電裝備和繞城高速公路安全、節能、環保科技示範兩項重大項目，共建國家冶煉裝備系統集成工程技術研究中心和重慶科技檢測中心兩個重點科技基地和平臺。

    王鴻舉市長在講話中指出，自去年重慶市政府與科技部建立部市會商機制以來，科技部對重慶不僅在工作層面給予了更多的指導和幫助，而且在重點項目及經費上也給予了更大的支持。他強調重慶市委市政府將一如既往地重視科技工作，並充分利用部市會商平臺，加強與科技部的互動，推動重慶經濟、科技的跨越式發展，為創新型國家建設作出新的更大貢獻。

    萬鋼部長在講話中充分肯定了重慶科技工作取得的良好成效，特別是會商一年來雙方富有成效的良好合作。他指出，面對重慶發展新的形勢要求，雙方要在推動高新技術産業發展和産業升級、統籌城鄉發展、節能減排、區域創新體系建設、營造激勵創新良好環境等方面加強深入合作。並強調，在落實會商工作中要注重貫徹落實科學發展觀、注重國家重大戰略目標與重慶需求統一、注重體制機制創新、注重提升區域創新能力。會商商定的重大項目，要抓住重要環節，加強管理，務必取得實效。他相信，通過雙方的共同努力，深入貫徹落實十七大精神，增強自主創新能力，科技創新在建設富裕、文明、和諧、開放的新重慶中必將發揮更加重要的作用。