2008年6月12日，應邀出席在沖繩舉辦的G8科技部長會議的科技部長萬鋼在途徑日本東京期間，拜會了文部科學大臣渡海紀三郎，就落實兩國首腦達成的共識，推動雙邊科技合作深入交換了意見。

    萬部長指出，胡錦濤主席的暖春之旅開啟了中日關係新的一頁，雙方決定全面推進戰略互惠關係，加強在能源、環保、高新技術和通信等領域的合作，雙邊科技合作迎來了新的發展機遇。雙方應該建立起長期穩定的科技合作機制，包括聯合實驗室等。中國的中長期科技發展規劃綱要把節能減排、新能源、環境保護作為第一要務，日本也有相應的計劃，雙方可以對接。在應對氣候變化、國際熱核聚變反應堆（ITER）方面，雙方有著共同的興趣，應該加強合作。萬部長特別介紹了四川汶川大地震造成的嚴重災害情況，希望雙方在相關的地震、地質、地震工程、生態環境、防災教育等諸方面開展深入合作，包括建立聯合實驗室等。萬部長還對日本在四川汶川大地震後向中方提供人力物力援助表示感謝，對於日本救援隊和醫療隊的專業水平、敬業精神和對人的尊重表示欽佩。

    渡海大臣表示，日方願意在地震和防災減災領域與中方開展全面合作，只要中方提出要求，日方可以隨時派專家赴華。渡海大臣還表示，去年隨首相訪華，雙方簽署了關於應對氣候變化科技合作的聯合聲明和加強聚變能研究合作的協議，希望在應對氣候變化、核聚變、環境領域開展更緊密的合作。有關建立共同研究機構問題，需要雙方在工作級別進一步磋商。雙方在環境和能源領域都有許多相近的研究課題，可以探索如何開展中長期合作。