直轄以來，尤其是近年來，重慶市通過世界銀行貸款、政府撥款和自籌資金等多方渠道資金籌措，大力加強應急監測能力建設，監測中心應急監測能力明顯提升，可實現對大氣環境、水質、土壤及固體廢物、物理環境等的現場快速檢測和流動車載監測。

    在大氣環境應急監測方面，擁有應急車、便攜式GC－MS、便攜式GC、有毒有害氣體檢測無線傳輸系統等儀器設備40余套，可現場測試50余項指標（在有標準的前提下，用便攜式GC－MS，則可上100余項）。在水質應急監測方面，擁有應急車、便攜式GC－MS、多參數水質測定儀、現場水質實驗室系統、發光細菌毒性檢測儀、RiverCat小型河流測速系統等儀器設備20余套，可現場測試30余項（在有標準的前提下，用便攜式GC－MS，則可上100余項）。在土壤及固體廢物監測方面，擁有便攜式X熒光光譜儀、便攜式GC等儀器，可測試鉻、鎘、銅、砷、汞、鉛、鋅、銻、鐵等多種金屬離子的濃度。在物理及環境參數監測方面，可測定現場氣象5參數，可進行簡單的稱量、對個人輻射劑量是否超標進行評價。