5月12日，民航局發出通知，對航空運輸應對甲型H1N1流感工作進一步作出部署。

    通知要求各機場在旅客辦理登機手續處的明顯位置設置公告，提示旅客如來自或7日內到過有疫情發生國家和地區、且自感有發熱等症狀的，應主動申報。申報有症狀的旅客，要由當地衛生部門作出是否可以進行航空旅行的建議。

    其次，民航局要求各國際（地區）定期航班通航機場，要在入境中轉旅客通道處設置體溫檢測設備和臨時停留點，對入境轉機旅客實施體溫檢測。如發現旅客發熱達37.5℃以上或有急性呼吸道症狀（簡稱有症狀者），要立即轉移到臨時停留點，並由當地衛生部門處理。

    各航空公司在執行國際（地區）航班任務時應配備適量的紅外線體溫檢測儀，對返程旅客進行體溫檢測。對有症狀且無法辦理退票手續的旅客要調整座位位置，儘量減少與其他旅客的接觸，並關注其健康狀況。機組人員在航班上如發現有症狀者，要按規定及時報告，並盡可能採取客艙內隔離措施。同時，要詳細記錄旅客信息。

    民航局還要求各航空公司嚴格執行航空器消毒措施。各有關單位要落實疫情信息報告工作，做好防控甲型H1N1流感的物資儲備，加強防控預案和各項防控措施的落實和人員培訓，提高員工衛生防病和個人防護意識。