為全面掌握我國R&D活動情況，更好地適應新形勢下宏觀管理的需求，經國務院批准，國家統計局、科技部、國家發展改革委、教育部、財政部、國防科工局決定聯合開展第二次全國R&D資源清查。

    第二次全國R&D資源清查的目的是全面調查了解我國R&D活動的總體規模和分佈情況；研發隊伍的規模和素質狀況；研發資源的投入、成果及産出效益情況；政府對R&D活動扶持政策的落實情況等。通過清查，進一步規範科技統計工作，完善科技統計指標體系，夯實統計基礎，提高數據質量，為制定“十二五”國民經濟和社會發展規劃及科技發展規劃，監測和評估我國自主創新能力和創新型國家建設進程提供依據。

    此次清查的對像是國民經濟中R&D活動相對密集行業的法人單位。涉及的範圍包括：農、林、牧、漁業，採礦業，製造業，電力、燃氣及水的生産和供應業，建築業，交通運輸、倉儲和郵政業，信息傳輸、計算機服務和軟體業，金融業，租賃和商務服務業，科學研究、技術服務和地質勘查業，水利、環境和公共設施管理業，教育，衛生、社會保障和社會福利業，文化、體育和娛樂業等。

    清查的主要內容包括R&D活動人員數量、素質及其工作量情況；R&D經費支出、用途及來源情況；研發用儀器設備等固定資産擁有情況；各類研發機構的基本情況；R&D項目（課題）的研究類型、組織方式及社會經濟目標等情況；專利等自主知識産權的擁有及使用情況；技術引進、消化吸收和技術改造情況；政府給予研發活動的稅收減免情況等。

    清查的標準時點為2009年12月31日，時期資料為2009年度。2011年底以前完成清查的數據庫建設和資料開發工作。