6月13日8時~14日8時,重慶東部、湖北南部、江西東北部、湖南北部、福建西北部、浙江南部及貴州北部局部地區降了大到暴雨,最大點雨量為:福建浦城128毫米,貴州桐梓121毫米,重慶武隆111毫米,江西資溪110毫米,湖南桑植102毫米。受降雨影響,福建閩江支流富屯溪洋口站、支流南浦溪水吉站,浙江杭嘉湖地區王江涇站及烏鎮站、飛雲河支流瑞平塘河平陽站等水位超警,幅度為0.06~0.31米。
6月3日以來,長江中下游地區連續出現較強降雨過程。據統計,6月3日8時~14日8時,前期嚴重受旱的湖北、湖南、江西、安徽、江蘇五省累計降雨量分別達94毫米、122毫米、172毫米、114毫米和38毫米。受降雨影響,近期長江中下游部分江河發生漲水過程,其中江西修水、信江、昌江上遊幹流、贛江支流錦江及薌水,湖南資水、汨羅江、湘江支流漣水及涓水,湖北陸水等河流發生超過警戒水位的洪水,超警幅度為0.02~1.44米,其中陸水上遊支流發生了超歷史記錄的特大洪水。
受沿線支流洪水匯入和三峽水庫前期持續補水的共同作用,長江中下游幹流水位總體呈波動式回升態勢。6月14日8時,長江中下游幹流及兩湖主要控制站宜昌、沙市、漢口、大通、城陵磯、湖口水位分別為41.74米、34.48米、19.93米、9.13米、26.42米和13.82米,較今年5月出現的最低水位分別抬升了2.00米、2.64米、5.08米、3.83米、4.93米和5.41米,但仍較多年同期水位分別偏低4.05米、3.39米、1.51米、1.82米、0.69米和1.93米,低於警戒水位5.27~11.26米。
受長江幹流水位持續回升和兩湖主要支流來水匯入的共同作用,洞庭湖、鄱陽湖的水面面積較前期乾旱時明顯擴大。水利部水文情報預報中心聯合水利部遙感技術應用中心根據遙感資料分析,洞庭湖城陵磯站今年乾旱低水位(22.03米,4月26日)時水面面積約352平方公里,6月9日城陵磯站水位達24.97米,洞庭湖水面面積約776平方公里,擴大了120%。鄱陽湖湖口站今年乾旱低水位(9.32米,4月23日)時水面面積約961平方公里,6月9日湖口站水位達11.3米,鄱陽湖水面面積約1379平方公里,擴大了近44%。