為進一步落實國務院領導關於重大專項審計調查整改工作的系列重要批示精神，加強重大專項組織管理，科技部、發展改革委、財政部三部門6月29日組織召開重大專項組織管理工作會，研究各專項審計調查整改工作方案和措施，並對下一步整改工作提出了要求。
各專項高度重視此次審計調查整改工作，認真對照審計署《重要信息要目 第45號》及各專項審計調查報告反映的問題，逐一認真核查，提出了具體的整改工作方案和措施，尤其是水污染治理專項反應迅速、組織有力、整改到位，寬帶移動通信、數控機床等專項認真查找問題、措施切實可行。此次審計調查未涉及的集成電路裝備專項、油氣開發專項也對照《重要信息要目 第45號》提出的問題開展自查，提出了下一步工作措施。
一、進一步完善立項遴選機制，提高立項質量。
一是進一步加強頂層設計和系統集成。數控機床專項提出要將資源向標誌性成果傾斜，在專項2013年年度計劃安排中，將緊密圍繞航空結構件製造裝備、高檔數控系統等標誌性成果部署相關任務。水污染治理專項提出將對“十二五”任務進行頂層設計優化，進一步明確各流域“十二五”目標和各年度課題任務設置的關聯關係；在2013年度計劃編制過程中，將在確保專項和主題目標實現的同時，從嚴控制、大力收縮，按照聚焦重點流域，強化標誌性成果産出，優中選優。
二是加強課題立項過程管理。寬帶移動通信專項將進一步完善評審機制，提高財務評審的分值權重，加強評審專家的組織、答辯評審順序安排、答辯現場管理等方面的工作。水污染治理專項明確提出課題承擔單位將全部通過公開擇優的方式確定，逐步推行課題視頻評審和網絡評審，對課題實施方案進行嚴密、細緻的論證；對於“十一五”課題尚未驗收又被批准或推薦為“十二五”滾動支持的32個課題，將在加快“十一五”課題驗收進度的基礎上，加強合同審查力度，並結合驗收和年度考核，對承擔單位實行動態調整。
三是合理分解研究任務，避免“小、散”。核高基專項在部署新課題時將嚴格控制課題聯合單位數量。寬帶移動通信專項提出明確要求，規定聯合單位數量不能超過4家，同時在合同中要求明確牽頭單位、聯合單位的任務分工，每個聯合單位單獨編制分單位預算。數控機床專項將加強任務與成果集中度，並同時加大系統部件配套和可靠性應用驗證的要求，逐步提升課題規模。水污染治理專項明確規定課題下將不再設子子課題、專題，減少研究層級，並要求課題承擔單位和參與單位原則上不超過5家。
二、進一步規範專項組織管理，保證實施進度。
一是建立健全相關管理制度。數控機床專項將進一步明晰各單位、各環節職責分工，增加專職人員配置，提高管理整體效能，結合工作實際，梳理、完善課題立項管理、課題過程管理細則、經費管理細則和驗收細則等，做到精細化管理。水污染治理專項將儘快修改完善《水體污染控制與治理科技重大專項實施管理辦法（試行）》，制訂《水體污染控制與治理科技重大專項立項管理辦法》，明確工作職責、工作機制以及立項的程序和要求。傳染病防治專項將制訂、修訂一個管理辦法以及14個管理細則（或工作規則），力爭做到以制度堵漏洞，以制度促規範，以制度強管理，以制度提效益。
二是嚴格合同審查，加快工作進度。核高基專項將認真核查，在今年8月份內完成2012年以前（含2012年）立項的所有課題任務合同書的簽訂工作。大型核電站專項將抓緊完成大型商用乏燃料後處理廠科研分項總體實施方案的上報工作。水污染治理專項將實行地方水專項辦公室、主題專家組、總體專家組、水專項管理辦公室四級審查程序，抓緊完成課題任務合同書的簽訂和經費撥付工作。傳染病防治專項提出在2012年立項項目合同書中，將在共同條款後增加相關任務和責任分解的條款，進一步明確專項管理要求，落實牽頭和參與單位的法人職責。
三是進一步加強課題檢查力度。寬帶移動通信專項已委託中咨公司組織開展檢查評估，對所有在研課題進行了全面檢查，同時，將在總體組責任專家全程跟蹤檢查課題的基礎上，委託總體組之外的專家對重點項目進展情況進行跟蹤檢查。數控機床專項將建立重點課題督查制度，針對每一項重點課題設立一個責任專家小組，每季度現場檢查一次，提交檢查報告，及時發現問題，督促課題按計劃實施。水污染治理專項將委託環保部督查中心對重點流域示範工程情況開展專項檢查，委託地方水專項管理辦公室開展結題課題示範工程第三方評估工作，確保地方配套工程和資金的落實。轉基因專項已組織成立8個督查組，將對專項課題全面開展檢查復核，對在研課題開展督導檢查，及時發現存在的苗頭性、傾向性問題；對已完成驗收的課題進行現場核查，確保驗收質量。新藥創制、傳染病防治專項明確提出將積極探索第三方抽查監督的評價機制，擬委託衛生部項目監管中心每年抽查20%課題。
四是發揮專家作用，強化隊伍管理。集成電路裝備專項充實了責任專家力量，擴充了財務專家和管理專家，將在關注項目技術進展的同時加強項目單位管理體系和資金使用的監督，尤其是院校、小課題單位，力爭做到不留死角，對發現問題及時採取措施。水污染治理專項起草了《水體污染控制與治理科技重大專項專家選聘、考核、調整和換屆工作細則》，計劃對專家組進行充實調整，加強對專家組的考核。
三、進一步嚴格成果和經費管理，發揮最大效益。
一是嚴格規範組織驗收。寬帶移動通信專項在技術驗收中，將委託中立第三方開展技術和設備測試以及知識産權的審查，確保成果滿足課題要求。數控機床專項將通過調整課題驗收方式、增加任務預驗收環節和規範用戶使用報告格式等方式加強驗收工作，課題驗收將一律採取用戶現場實地考察方式進行考核。油氣開發專項將對“十一五”驗收完成的43個項目（237個課題）和22個示範工程全面開展自查抽查工作。
二是全面系統審核成果。數控機床專項將建立數據庫，對課題成果進行嚴格審核，避免成果抵充現象的發生，如發現有衝抵現象，則該課題以驗收不通過處理，並酌情追究課題責任單位、課題組長的責任。水污染治理專項明確規定，對於“多頭交賬”成果，將給予不良信用記錄，取消該主持人三年內其承擔水專項課題的資格和該單位一年內承擔水專項任務的資格。新藥創制專項將全面開展自查自糾工作，對“十一五”計劃驗收材料中新藥證書、發表論文、獲得專利等情況進行再次復核。
三是動態實時管理經費。集成電路專項通過與銀行溝通，將加強項目承擔單位專用賬戶的動態管控，杜絕管理死角，並由實施管理辦公室主任每月召開審計會議。寬帶移動通信專項提出將定期開展第三方評估檢查，並委託會計師事務所對經費使用情況跟蹤檢查。水污染治理專項已將專項經費執行情況檢查納入部門內審的重點工作，對存在問題的課題將進行通報並限期整改，對財務驗收不通過的單位將限制其承擔新的研究任務。
四是嚴肅查處違規問題。數控機床專項已責成北京機電研究所按照課題任務書要求完成任務，在該項任務完成之前，不得參與專項工作；已暫停國家鑄造鍛壓檢驗中心檢測專項産品的資格，並將所存在問題通報其行業主管部門。水污染治理專項已取消相關單位承擔水專項“十二五”課題的資格，對有關單位和課題逐一發出整改通知單，約談單位相關負責人，將採用通報、黃牌警告、停止課題等方式限期整改。新藥創制、傳染病防治專項已前往中國人民大學、北京中醫藥大學了解情況，並提出進一步核實、加強整改，完善制度等要求，相關課題涉嫌套取的資金已全部追回。
會議充分交流、討論了各專項的整改方案和具體措施，起到了交流思想、促進工作的作用。會議認為，要進一步提高認識，高度重視此次審計調查整改工作，切實加強重大專項的組織管理。要做好這項工作，健全各項管理制度是基礎，建立機制、落實責任是保障，加強全過程管理和監管是重點，發揮各部門、地方、社會等方面的作用是關鍵。
會議指出，當前首要的工作是要把審計調查中發現的重點問題逐一整改落實，該調整承擔單位、終止課題、收回經費、給予處罰的都要認真核查、及時處理。下一步，要進一步完善整改工作方案、細化整改措施，力爭儘快整改出實效，推動重大專項順利實施。
