2013年，村鎮建設司總體工作將貫徹落實黨的十八大和全國住房城鄉建設工作會議精神，加大對全國村鎮建設的指導力度和支持力度，鞏固提高既有工作水平，開創新局面。同時，重點抓好農村危房改造、指導農房建設、指導和支持小城鎮建設、保護髮展傳統村落、開展美麗宜居小鎮和美麗宜居村莊示範、指導村莊規劃、建設全國村鎮建設信息系統、加強大別山片區扶貧聯絡等工作。
大力推進農村危房改造
協調有關部門制定2013年農村危房改造政策，下達中央任務及補助資金，適當對貧困地區給予傾斜。指導和督促各地制訂與完善不同地區、不同對象的省級分類補助標準，從任務安排、補助標準上落實對特困地區、特困農戶的傾斜照顧。組織制訂並實施農村危房改造最低建設標準。加大建築節能示範力度，加強技術指導與監管。繼續完善農村危房改造農戶檔案管理信息系統，試行農戶檔案信息公開工作。完善監督檢查與績效評價制度，組織實施2013年度檢查與績效考核。繼續實施月度進度報表制度，定期匯總和提供全國進度數據。適時召開有關現場會，推廣好的做法與經驗。
組織實施以船為家漁民上岸安居工程。配合有關部門完成以船為家漁戶居住情況摸底調查。會同有關部門組織實施以船為家漁民上岸安居工程。加強對各地實施以船為家漁民上岸安居工程的指導與監管，組織開發並運行全國以船為家漁民上岸安居工程漁戶檔案管理信息系統。
開展農房建設管理和指導
開展農房風貌治理示範工作。把握打造美麗鄉村的重點在農房這一關鍵問題，以縣（市）為示範單位，結合農村危房改造和美麗宜居村莊示範工作，運用經濟手段和鄉村建設規劃許可等手段，建立管理機制，加強設計和建造指導，開展農房風貌治理示範工作。
開展優秀農房設計建造範例評選與推廣工作。制訂評選標準和要求。啟動評選工作並評出一批外觀傳統、內部結構及功能現代化的優秀農房設計建造範例，組織開展研究與推廣工作。
繼續推進現代生土綠色民居示範。總結甘肅省白銀市會寧縣示範項目經驗，實施新疆、大別山片區示範項目，進一步將示範範圍擴大到河北省保定市阜平縣和江西省贛州市。組織開展現代生土綠色民居有關技術實驗工作，研發相關技術、設備和材料。委託有關單位製作現代生土綠色民居建造技術科教片。
推進傳統村落保護髮展
加快完善中國傳統村落名錄。指導各地做好傳統村落補充調查工作，登記上報補充調查結果，推薦上報中國傳統村落。修改完善傳統村落評審認定工作辦法，組織開展中國傳統村落評審認定，公佈第二批列入中國傳統村落名錄的村落名單。
編制全國傳統村落保護髮展規劃綱要。依託現狀調查，總結傳統村落分佈及其存續特徵，分析傳統村落保護髮展存在的突出問題，明確保護髮展總體要求、工作目標，提出保護髮展基本原則和技術路線，確定保護髮展重點任務和保障措施。
制定傳統村落保護髮展支持政策。制定支持中國傳統村落保護髮展規劃編制補助支持政策，會同有關部門組織開展保護髮展規劃編制檢查工作。選擇有條件的地區開展搶救性保護試點工作，補助支持有較高保護價值傳統文化遺産的保護修繕，探索制定保護髮展綜合支持政策。
探索建立傳統村落保護髮展管理制度。明確各級住房城鄉建設部門和鄉鎮政府傳統村落保護髮展管理責任，落實村民保護髮展實施機制。建立中國傳統村落檔案，實施掛牌保護制度。建立監測信息系統，對中國傳統村落保護髮展進行監測，並對保護髮展工作進行檢查。
加強傳統村落保護髮展技術指導。提出傳統村落保護髮展規劃編制要求，編制技術指南，指導中國傳統村落保護髮展規劃編制和修編。制訂傳統村落搶救性保護技術指南，明確基本原則、總體要求和分地區技術要點，開展保護和修復現場指導工作。
做好宣傳和培訓工作。編印中國傳統村落名錄圖冊。開通中國傳統村落專題網站。組織中國傳統村落公益宣傳活動，加大與中央電視臺合作宣傳力度。適時召開傳統村落保護髮展現場會。組織開展基層傳統村落保護髮展技術管理人員培訓。
加強小城鎮建設指導和支持
擴大調整全國重點鎮。協調有關部委，擴大調整全國重點鎮。建立全國重點鎮基礎信息、總體規劃、重點項目信息庫，組織編制全國重點鎮年度報告。研究制定全國重點鎮支持政策。
推動綠色低碳小城鎮建設。協調有關部委，擴大綠色低碳重點小城鎮試點。研究提出綠色、低碳、集約小城鎮建設關鍵措施，制定引導和支持政策。調整綠色低碳小城鎮建設評價指標體系，完善綠色低碳小城鎮建設專家指導工作機制。
推進國家特色景觀旅遊名鎮名村工作。指導各地做好名鎮名村核心景觀資源登記上報，開展核心景觀資源保護專項檢查，組織名鎮名村集中推介和市場對接，落實名鎮名村服務監督管理具體措施。開通國家特色景觀旅遊名鎮名村網站。組織開展第三批示範申報和評審。
做好中央支持的重點鎮污水處理設施配套管網建設項目實施監督和指導。印發關於加強重點流域重點鎮污水處理設施配套管網建設管理的通知，發揮污水管網網站作用，掌握項目實施進展，做好項目實施監督。探索信貸支持小城鎮建設的可行辦法。
開展舊鎮改造和小城鎮管理試點。選擇有條件的地區，開展舊鎮改造試點，探索改造更新、完善基本功能、改善人居環境的機制和技術方法。開展小城鎮規劃建設管理試點。
提升村鎮規划水平
落實中央一號文件關於科學規劃村莊建設的精神，以從原點開始的精神，探索建立符合農村實際、行之有效的村莊規劃的理念和方法。
開展村莊規劃示範，明確村莊規劃示範要求，遴選試點村和規劃編制單位，給予一定資金支持。做好試點村莊規劃編制的指導、檢查和評審。編制不同類型的村莊規劃技術指南，編輯示範村優秀村莊規劃案例集，召開經驗交流會和培訓，予以推廣。
印發加強和改進鎮規劃編制和實施工作的指導意見。開展鎮（鄉）規劃試點，開展全國優秀村鎮規劃評選。
制訂鄉村規劃建設許可證實施管理辦法，制訂鎮鄉村莊規劃編制辦法。組織開展村鎮規劃基礎理論研究。
研究城鎮規劃區外鄉村建設強度和控制性要求。
加強村莊環境整治指導
總結推廣農村垃圾污水治理適宜技術。收集各地使用效果較好的農村垃圾污水處理技術和相關科研項目成果，組織專家評審，推出一批成熟的、效果好的農村生活污水、生活垃圾處理適宜技術，制訂技術指南和操作手冊。總結推廣村莊環境整治、縣域村鎮污水垃圾綜合治理經驗，組織參觀和培訓。
結合地方積極性，開展農村垃圾綜合治理試點。
繼續指導建材下鄉試點。指導有積極性的地區探索建材下鄉試點經驗。
開展美麗宜居小鎮村莊示範工作
印發中國美麗宜居小鎮、美麗宜居村莊示範工作通知，制訂中國美麗小鎮、美麗村莊示範指導性要求。指導並推動各地示範工作，適時組織中國美麗宜居小鎮、美麗鄉村宜居示範認定。
建立村鎮規劃建設管理信息系統
以為各級村鎮管理部門提供好的管理工具為主要目的，建立村鎮規劃建設管理信息系統。開展村鎮規劃建設信息系統需求調研，設定與村鎮規劃建設管理業務相關的目標、基本評價指標體系和數據集，初步建立信息系統。
加強制度和政策研究
加快制定村鎮規劃建設管理條例。
開展農村宅基地制度改革研究。開展新型城鎮化中的村鎮建設基本思路和體制及政策研究。
出臺加強村鎮建設管理員隊伍建設意見，提升基層農村危房改造管理能力。
做好大別山片區聯絡等扶貧工作
落實支持大別山片區住房和城鄉建設事業發展的意見。加強片區與中央有關部門的聯絡。建立有關大別山扶貧工作的網站，幫助宣傳。
組織開展36縣縣級領導幹部、住房城鄉建設部門負責人赴東部發達地區培訓。協調有關部門動員組織社會力量重點支持規劃試點村莊的項目。
協助其他片區的聯絡工作以及西藏和四省藏區相關扶貧工作。配合有關部門落實支持贛南等原中央蘇區、推進遊牧民定居工程等有關工作。
編制河北省太行山地區村莊整治規劃技術指南，支持開展規劃編制人員培訓和村莊整治示範。
