長江口12.5米深水航道投入運行兩年來，通航水深保證率保持在95%以上，吃水12米以上船舶通過量增幅明顯，2012年通過530艘次，較2010年增長18.92倍。
2011年5月18日，長江口深水航道工程全面竣工。兩年來，長江口航道管理局始終把水深線視為“生命線”，堅持不懈抓維護疏浚管理，確保水深通航保證率。航道水深的持續穩定，帶來了大型船舶通航量的持續攀高。海事部門數據顯示，2012年通過長江口深水航道的船舶總量為47536艘次，日均149艘次，較2010年長江口12.5米深水航道試通航當年的43041艘次增長了10.44%。交通運輸部水運科學研究院統計表明，通航船舶大型化趨勢強勁，2012年通過長江口深水航道的船舶平均載重噸已達35477噸。2012年通過長江口的貨運量為10.5億噸，較2010年增長15.4%。長江口深水航道對上海國際航運中心建設發展起到了有力的支撐作用。上海港2012年完成貨物吞吐量7.36億噸、集裝箱吞吐量3253.9萬標箱，其中有約60%是在長江口內港區完成的。
