２００２年８月３日，世界台灣同鄉會聯合會第二十九屆年會在日本東京舉行，陳水扁透過電視直播方式致詞宣稱，“台灣是主權獨立的國家”，“台灣與大陸，一邊一國，要分清楚”，他並鼓吹“公民投票”決定“台灣前途”。

　　陳水扁“一邊一國”論引起了台灣在野黨的強烈質疑，親民黨主席宋楚瑜抨擊陳水扁的談話嚴重違背了“總統”就職典禮時對民眾的承諾，是“四不一沒有”主張的完全破産。國民黨主席連戰批陳水扁“是將台灣二千三百萬人民，與‘台獨’的火藥庫綁在一起”，兩岸關係可能會因此變得緊張。

　　對於陳水扁的言論，台灣《中國時報》發表評論説，陳水扁已經“變臉”了，他的“一邊一國”論，其實就是李登輝“兩國論”的另一説法。陳水扁從承諾不介入黨務，到兼任民進黨主席；從保證在任期內不會推動“兩國論”入憲，不會推動改變現狀的“統獨公投”，到宣示“一邊一國”，並要“認真思考‘公投法’的迫切性”，這不僅是陳水扁政治承諾漸進崩盤的訊號，更是兩岸互動陷入不確定狀態的起點。

　　８月５日，國臺辦召開新聞發佈會指出，陳水扁的“一邊一國”論與李登輝“兩國論”如出一轍，充分暴露了他頑固堅持“台獨”立場的真面目，是對包括台灣同胞在內的全體中國人民的公然挑釁，也是對國際社會公認的一個中國原則的公然挑釁，必將對兩岸關係造成嚴重的破壞，影響亞太地區的穩定與和平。國臺辦警告台灣分裂勢力懸崖勒馬，停止一切分裂活動。