學校自備水源是指為解決學校用水而建的水塔、蓄水池、水井等給水設施。因學校自備水源被污染造成腸道傳染病流行的事件每年時有發生。因此，加強學校自備水源的管理是預防學校腸道傳染病流行的關鍵措施之一。學校應嚴格按照《生活飲用水集中式供水單位衛生規範》、《二次供水設施衛生規範》的有關要求管理自備水源。1. 學校應建立相應的自備水源衛生管理規章制度，並安排專職（或兼職）人員負責其管理，水源管理人員每年必須進行體檢，經體檢合格者方能上崗。

    2. 水源管理人員須定期清理水源的周圍環境，保持清潔衛生。

    3. 學校應當為學生提供充足的符合衛生標準的飲用水。

    4. 學校若使用自備水井，應定期（每季度）請疾病預防控制部門進行水質檢測，防止水污染事件的發生。

    5. 學校採取水塔、蓄水池進行二次供水的，必須按照《二次供水設施衛生規範》的要求，加強衛生管理，並建立定期清洗制度，確保供水符合衛生標準。

    7. 設置合理的洗手設施：有許多腸道傳染病是通過手來傳播的，如果教師或學生接觸一個生病的學生後，未經洗手又接觸另外一個學生，便可把病原體從第一位學生帶到第二位學生身上。因此，配備合理的洗手設施對於預防控制傳染病的發生是十分必要的。洗手設施的設置應以方便學生使用為原則，特別是方便學生飯前便後、運動前後洗手。有條件的學校可在洗手設施旁配備洗手液或肥皂，並由專人管理，保持洗手設施無積水、無污物。