為動態了解義務教育實施情況及存在的問題，更好地為科學決策服務，教育部于2002年底啟動了義務教育監測系統，四年來共進行了五次監測。2006年在三年前對初中輟學情況進行監測的基礎上，再次對農村初中生輟學情況進行了監測。

    本次監測對象為72個義務教育監測項目縣（市、區）（以下簡稱"監測縣"）的2000多所初中學校，監測時段以2005年秋季開學為基點，至2006年5月10日，共8個月，對每個月學生輟學的情況均進行了監測。監測數據由學校通過網絡直接報送給教育部義務教育監測辦公室，首次建立了輟學學生個體信息數據庫。通過監測，對農村初中生在監測時段內休學、退學、未辦理學籍手續離校不再上學、未辦理學籍手續離校不知去向等情況做了全面了解，並對輟學學生的數量、分佈及特徵進行了深入分析。

    監測發現，2006年春季開學後，西部地區實施農村義務教育經費保障機制改革，由於取消了義務教育階段學雜費、教科書費、同時對貧困家庭寄宿生給予生活補助，許多農村學校出現了進城務工農民子女回流、輟學生複學、民辦學校學生轉入公辦學校的現象，有效降低了農村初中的輟學率。但在新形勢下農村初中生輟學也出現了一些新特點，主要是學生厭學，打工農民子女就學得不到保障，留守兒童輟學增加等，需要進一步跟蹤監測，並提出相應的解決措施。