轄玉樹、稱多、囊謙、雜多、治多、曲麻萊6縣，1鎮、47個鄉，257個村牧委會，1048個農牧業生産合作社。自治州首府駐玉樹縣結古鎮，是全州政治、經濟、文化、交通的中心。 1999年全州總人口為25.27萬人，其中藏族佔97％，漢族、回族、土族、蒙古族、撒拉族、苗族、布依族、壯族、滿族、朝鮮族等民族佔全州總人口的3％，為全國少數民族人口比例最高的自治州。在總人口中農牧業人口31萬人。