在充分醞釀與協商的基礎上，2006年10月16日，科學技術部、四川省人民政府在成都簽訂《科學技術部、四川省人民政府工作會商制度議定書》並召開部省第一次工作會商會。科技部黨組書記、部長徐冠華，四川省委副書記、省長張中偉，省委副書記、常務副省長蔣巨峰，省委副書記甘道明，省人民政府副省長柯尊平，科技部副秘書長王志學，科技部、四川省有關部門負責人出席了會議。會議由王志學副秘書長主持，省委副書記、常務副省長蔣巨峰同志宣讀《部省工作會商制度議定書》，柯尊平副省長介紹了四川省的相關情況。徐冠華部長、張中偉省長分別代表科技部和四川省人民政府在議定書上簽字，並作了重要講話。

    《科學技術部 四川省人民政府工作會商制度議定書》明確了六個方面的主題和會商內容：一是共同推進綿陽科技城、成都高新區的發展；二是共同推進中醫藥現代化和國際化；三是共同推進釩鈦新材料産業發展；四是共同推進生物技術産業的發展；五是共同推動有關的國家重大科技項目在四川實施，加強四川科技基礎條件平臺建設；六是共同推進體制機制改革，加快四川區域創新體系建設。

    張中偉省長表示，四川將以這次建立部省工作會商機制為契機，把四川的科技優勢進一步轉化為經濟優勢。將與科技部一道，以發揮四川科技資源比較優勢，提高區域創新能力為重點，共同推進具有四川特色的科技産業的發展，加快新型工業化進程；共同推進四川農業科技自主創新，大力發展現代農業；共同推進以企業為主體的技術創新體系建設，不斷提升企業創新能力。

    徐部長強調，四川省與科技部建立省部工作會商機制這一舉措，必將進一步加強部省合作，增強四川承接和參與國家重大科技計劃的能力，推動四川科技進步和創新發揮十分重要的作用。並對綿陽科技城建設、成都高新區建設、釩鈦新材料産業基地發展、推進體制機制改革、加快四川區域創新體系建設等部省共建問題作了重要指示。