近年來，為確保三峽庫區水環境安全，重慶市加強了三峽庫區水環境質量的監測預警能力建設，形成了常規項目監測能力，對長江入境斷面實施了自動監測，對重點污染源安裝了在線監測，基本能夠達到管理的需要。

    為全面反映三峽庫區水環境質量狀況和變化趨勢、跟蹤污染源變化情況、準確預警並及時處置各類環境突發事件，確保庫區水環境安全，重慶市將按照國務院3號文件“加強三峽庫區生態環境監測系統建設”的要求，加快完善水環境質量動態監控預警體系建設，著力提高三峽庫區水環境質量監控數據採集、傳輸和預測預警能力。主要建設內容包括：水環境監測系統、水污染事故應急處置系統、環境數據傳輸網絡、環境預測預警與決策支持系統四個方面。到2012年初步形成自動監測、常規監測與應急監測相結合的監測體系和環境應急指揮體系，構建三峽庫區水環境質量監測和污染源監控數據傳輸骨幹網，建設一個集水環境動態監控監測、信息傳輸、應急處置、預測預警、信息發佈與決策支持為一體的技術先進、性能完善、安全高效的綜合應用系統。