6月29日，衛生部黨組書記張茅在衛生部衛生經濟研究所調研時説，醫藥衛生體制改革及國民健康發展規劃等大政方針給衛生經濟研究帶來了新的契機，也提出了新的任務，希望該所發揮實踐性強的特色，為衛生改革與發展作出新的貢獻。
張茅指出，當前是深入推進醫藥衛生體制改革的關鍵時期，群眾能否從醫改政策中得到實惠，需要持續深入的科學研究。例如，通過醫院支付方式改革，可從根本上改變對醫院的管理方式及醫院的內部管理機制。該所應力爭拿出研究成果，供決策部門參考。
據衛生部衛生經濟研究所所長張振忠介紹，2008年，該所開展了74項與改革和管理相關的課題研究，其中新農合財務管理制度、新農合信息規範、公共衛生投入機制等7項研究成果已經轉化為國家政策。而甲型H1N1流感的費用成本測算研究、防控措施成本效果研究等成果，為國家制定應對疫情相關政策提供了科學依據。
