按照《2010年衛生部機關及部屬（管）單位“小金庫”專項治理工作方案》及《關於開展2010年“小金庫”專項治理重點檢查的通知》要求，從9月份開始，部屬（管）單位全面開展了“小金庫”專項治理和財務檢查工作。

    中國疾病預防控制中心督導檢查範圍涵蓋了所有直屬單位。在督導檢查組人員的配備上，實行多部門抽調，由黨辦、紀檢監察、人事、財務、審計、開發、後勤等7個部門人員組成。在督導檢查形式上採取聽取彙報、開展座談、個別談話、查閱資料的方式，最終出具督導檢查報告。根據檢查結果來看，中心本級自查發現“小金庫”1個，屬於部門會議經費結余未及時轉回單位類型，計7427元，目前此筆經費已退回中心財務，完成整改。這次財務檢查總體來看，中心各單位對重大經濟開支、重大資金使用等“三重一大”事項執行比較到位，能夠嚴格按照有關規定和標準執行，針對2009年中心檢查組提出的問題認真進行整改，並加大宣傳力度，通過健全制度來規範經濟行為。同時也檢查出預算管理、委託經費管理、資産管理等方面操作不規範，財務資料歸檔不及時等問題。針對這些問題，中心採取對財務人員進行會計基礎規範和內部控制培訓、成立預算工作委員會、整理財務制度等措施，把“小金庫”治理作為財務檢查的重要內容來抓，完善制度建設，構建長效機制。

    中國醫學科學院深入推進“小金庫”專項治理工作，院校機關及各所院均成立了國有企業“小金庫”專項治理領導機構，對國有全資和控股企業進行了清查。各所院按照工作方案要求對所屬企業開展重點檢查工作。院校機關由審計部門、財務部門和國資部門組成聯合檢查組，目前已對機關直屬的協和醫藥總公司、出版社和音像出版社進行了重點檢查工作。按照2010年“小金庫”專項治理工作方案要求，院校“小金庫”治理領導小組辦公室將於11月份開展對各所院國有全資及控股企業的重點抽查工作，抽查面為20%。

    部屬（管）其他單位也積極開展“小金庫”專項檢查工作，並組織人員對下屬國有及國有控股企業進行了自查。針對檢查中發現的問題，進行分析總結和整改落實，對規範財務管理，完善內部控制，建立“小金庫”預防的長效機制起到了促進作用。