為進一步加強中央補助地方專項資金管理，推進系統基礎設施建設項目順利實施，全面了解和掌握中央財政資金使用情況，國家食品藥品監督管理局決定從2009年11月2日起，對中西部地區專項實施情況進行檢查。10月29日，國家食品藥品監督管理局召開中央財政資金專項檢查部署工作會議，中央紀委駐局紀檢組組長李東海、國家食品藥品監督管理局副局長李繼平出席會議並提出工作要求。

    李東海表示，這次檢查不僅是對地方使用中央財政資金情況的檢查，同時也是對國家局資金安排和管理工作的一次檢驗,是保證中央財政取之於民、用之於民的必要措施，是提高財政資金使用效益、保證財政資金安全的必要措施，從根本上説，也是為了今後爭取中央財政更多支持，更好地保證人民群眾飲食用藥安全。這次檢查在不同省份之間交叉進行，就是要保證檢查組鐵面無私地執行任務。李東海強調，本次檢查實行組長負責制，他要求組長以對事業高度負責的態度，切實負起責任，圓滿完成國家局交給的任務。

    李繼平説，開展中央財政資金專項檢查，是保障國家財政資金使用安全有效的必然要求，是履行資金監管職責的應有之舉，是繼續爭取財政支持的重要依據。做好檢查工作，不僅對加強項目資金管理、確保資金使用安全、提高資金使用效益具有重要意義，而且對全系統進一步總結經驗，為下一階段積極爭取支持，加大系統投入，提高整個系統監管能力具有重要意義。

    這是國家局第一次開展大規模的中央財政資金專項檢查，涉及20個省（區、市）。前一階段，各省（區、市）已經開展了自查自糾工作，國家局也在3個省開展了試點檢查，這次檢查是在試點基礎上開展的全面檢查。

    這次檢查主要有三個方面內容：一是2006～2008年中央補助地方食品藥品監管能力建設資金使用情況。二是“十一五”規劃期間中央補助地方基本建設項目的實施情況。三是2007～2008年國家食品藥品監督管理局委託地方食品藥品監督管理局專項工作經費使用情況。

    這次部署工作會議由國家食品藥品監督管理局辦公室（規劃財務司）與駐局監察局共同召開，國家食品藥品監督管理局辦公室（規劃財務司）、駐局監察局主要負責人以及各省局規劃財務處負責人、各檢查組組長參加會議。