第四次政府機構改革始於１９９８年。這次改革精簡力度很大，改革前國務院有４０個組成部委，結果減少了１１個。另一個突出特點是，行政管理從具體的工業經濟管理中淡出。除了國防科技工業和信息産業兩個管理部門外，這次改革將其他直接管理工業的１０個部委都撤消了。同時，在國務院和省級政府機構，提出公務人員要減一半，國務院當時３．４萬人減了１．７萬人。